Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/106366
Títol: | Generació i anàlisi d'un model per relacionar el microbioma humà i dades clíniques amb malalties autoimmunitàries |
Autoria: | Canet Carbó, Joan |
Tutor: | Paytuví Gallart, Andreu |
Altres: | Prados Carrasco, Ferran |
Resum: | Diferents composicions taxonòmiques al microbioma intestinal han estat relacionades a algunes malalties com la diabetis o la malaltia de Crohn. En aquest projecte s'han descrit la composició microbiològica de mostres fecals i variables clíniques -com l'edat o l'índex de massa corporal- associades a un gran nombre d'individus. S'han generat diferents models amb algoritmes de Machine Learning, com Random Forest, Support Vector Machine i XGBoost, per predir si un subjecte ha desenvolupat, o no, alguna malaltia autoimmunitària, a partir de la seua composició taxonòmica intestinal i unes variables clíniques. Els resultats obtinguts a la descripció taxonòmica no mostren uns enterotips clarament diferenciats entre les mostres. La majoria de les variables clíniques categòriques no estan segueixen una distribució equilibrada de les classes. Les distribució de les variables clíniques numèriques analitzades sí que s'aproximen a una distribució normal. El millor model de classificació s'ha obtingut utilitzant un mètode de mostratge anomenat SMOTE per a generar les dades d'entrenament i emprant l'algoritme XGBoost, obtenint un valor de l'estadístic Kappa de 0.6612. Aquest valor es considera que té una adequació substancial a les dades reals. El gènere Bifidobacterium ha sigut el que més ha contribuït en el rendiment del model. A tall de cloenda, no s'han pogut classificar les mostres en enterotips clarament diferenciats; no obstant això, s'ha pogut generar un model per predir si una persona ha desenvolupat, o no, una malaltia autoimmunitària, utilitzant dades del microbioma intestinal i variables clíniques amb una adequació substancial a les dades reals. |
Paraules clau: | microbioma humà malalties autoimmunitàries aprenentatge automàtic |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 3-gen-2020 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
jcanetcarboTFM0120memòria.pdf | Memòria del TFM | 2,19 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons