Estudio de la microbiota subgingival en sujetos sanos y pacientes con periodontitis de distintos orígenes geográficos

Abstract

La periodontitis es una inflamación de los tejidos periodontales que puede derivar en la pérdida de piezas dentales. Se ha descrito que un biofilm subgingival disbiótico puede causar esta inflamación, y por lo tanto se han dedicado muchos esfuerzos a la caracterización de la microbiota causante de la periodontitis. Estos estudios de caracterización han construido perfiles microbianos del biofilm subgingival en estado de salud y de enfermedad periodontal, aunque centrándose en poblaciones locales y sin tener en cuenta la variabilidad que el origen geográfico de las muestras puede aportar, creando un sesgo al universalizar dichos perfiles. Para determinar si existen diferencias significativas entre la microbiota subgingival de individuos sanos y de pacientes con periodontitis de 4 orígenes geográficos distintos (Bélgica, Perú, Chile y España), en este estudio se analizaron muestras subgingivales mediante secuenciación masiva, determinando la diversidad, riqueza y composición bacteriana en las muestras según su diagnóstico y origen geográfico. Las secuencias fueron procesadas mediante el programa mothur y el análisis estadístico se realizó con los paquetes estadísticos PhyloSeq, Vegan y DESeq2. Los resultados mostraron que existen diferencias significativas tanto por diagnóstico como por origen geográfico de las muestras, lo cual abre la puerta a realizar más estudios para analizar las causas y consecuencias de esta variabilidad.

Periodontitis is an inflammatory disease of the periodontal tissues, which can lead to tooth loss. It has been described that a dysbiotic subgingival biofilm can be the cause of such inflamation, and therefore many efforts have focused in the characterization of the microbiota that might cause periodontitis. These studies have built microbial profiles of the healthy and periodontitis-related subgingival biofilm, although based in local populations and without taking into account the variability that the geographical origin can add to the samples, thus creating a bias when universalizing such profiles. In order to assess if there are significant differences among the subgingival microbiota of healthy subjects and patients with periodontitis of 4 different geographical origins (Belgium, Peru, Chile and Spain), subgingival samples were analyzed using next generation sequencing, evaluating their diversity, richness and bacterial composition according to their diagnostic and geographical origin. Sequences wereprocessed through the software mothur and the statistical analyses were performed using the R statistical packages PhyloSeq, Vegan and DESeq2. Results showed that there are significant differences in the samples, both by diagnostic and by geographical origin, which opens the door to further studies in order to analyze the causes and consequences of such variability.

La periodontitis és una inflamació dels teixits periodontals que pot derivar en la pèrdua de peces dentals. S'ha descrit que un biofilm subgingival disbiótico pot causar aquesta inflamació, i per tant s'han dedicat molts esforços a la caracterització de la microbiota causant de la periodontitis. Aquests estudis de caracterització s'han construït perfils microbians de l'biofilm subgingival en estat de salut i de malaltia periodontal, encara que centrant-se en poblacions locals i sense tenir en compte la variabilitat que l'origen geogràfic de les mostres pot aportar, creant un biaix a l'universalitzar aquests perfils. Per determinar si hi ha diferències significatives entre la microbiota subgingival d'individus sans i de pacients amb periodontitis de 4 orígens geogràfics diferents (Bèlgica, Perú, Xile i Espanya), en aquest estudi es van analitzar mostres subgingivals mitjançant seqüenciació massiva, determinant la diversitat, riquesa i composició bacteriana en les mostres segons el seu diagnòstic i origen geogràfic. Les seqüències van ser processades mitjançant el programa mothur i l'anàlisi estadística es va realitzar amb els paquets estadístics PhyloSeq, Vegan i DESeq2. Els resultats van mostrar que hi ha diferències significatives tant per diagnòstic com per origen geogràfic de les mostres, la qual cosa obre la porta a realitzar més estudis per analitzar les causes i conseqüències d'aquesta variabilitat.