Estudio de la comunidad microbiana asociada al intestino de la corvina

Abstract

Este estudio tiene como objetivo explorar la microbiota intestinal de la corvina (Argyrosomus regius) y evaluar el efecto de la dieta en la composición, abundancia y diversidad de esta. En los últimos años, el estudio del microbioma ha cobrado relevancia debido a su influencia e implicación en diversas funciones del hospedador relacionadas con el metabolismo y la salud. Conocer la composición, abundancia y diversidad de la microbiota es necesario para la comprensión de su implicación en estos procesos. Entre los factores extrínsecos que modulan la microbiota, la dieta juega un papel muy importante. En este estudio se alimentaron 750 corvinas con cinco dietas basadas en fuentes de proteínas distintas [dieta control (DC), dieta de microalgas (DM), dieta de harina de insectos (DI), dieta de residuos del enlatado del atún (DP.L) y dieta mezcla de las tres anteriores (DMix)] y se analizaron seis muestras de cada grupo. Se secuenció un fragmento del gen 16S ARNr a través de la tecnología MiSeq® de IIlumina®, y se realizó un análisis bioinformático con la herramienta QIIME2, y un análisis bioestadístico con el paquete microeco de R. El estudio reveló que Mycoplasma, Enterobacter, Bacillus y Flavobacterium fueron los géneros más abundantes. El grupo DM mostró un mayor índice de Shannon (H = 2,54 ¿ 0,91). Según las distancias de Bray-Curtis, las comparaciones entre grupos no fueron estadísticamente significativas. Aunque los resultados entre las diferentes dietas no fueron significativos, este estudio describe por primera vez la composición de la comunidad microbiana del intestino de la corvina.

This study aims to explore the meagre (Argyrosomus regius) microbiota, in order to evaluate the effect of the diet on the composition, abundance and diversity of its microbiota. In the least years, the study of the microbiome has gained relevance due to its influence and involvement in various host functions related to metabolism and health. Comprehend the composition, abundance, and diversity of the microbiota is necessary for understanding its involvement in these processes. Moreover, diet plays a very important role between the extrinsic factors that modulate the microbiota. In this study, 750 meagre were fed with five diets based on different protein sources [control diet (CD), microalgae diet (MD), insect meal diet (ID), protein and oil from water of tuna canning process (P&LD) and mixture diet (MixD)] and six samples from each group were analyzed. A fragment of the 16S rRNA gene was sequenced using the MiSeq® technology from Illumina®. The bioinformatic and biostatistical analysis were performed with QIIME2 and microeco package from R, respectively. The study revealed that Mycoplasma, Enterobacter, Bacillus and Flavobacterium were the most abundant genus. The higher Shannon index was revealed by the MD group (H = 2,54 ¿ 0,91). According to Bray-Curtis distances, the comparisons between groups were not statistically significant. Although the results between the different diets were not significant, this study describes the composition of the microbial community of the meagre gut for the first time ever.

Aquest estudi té com a objectiu explorar la microbiota intestinal de la corbina (Argyrosomus regius) i avaluar l'efecte de la dieta en la composició, abundància i diversitat d'aquesta. En els últims anys, l'estudi del microbioma ha cobrat rellevància a causa de la seva influència i implicació en diverses funcions de l'hoste relacionades amb el metabolisme i la salut. Conèixer la composició, abundància i diversitat de la microbiota és necessari per a la comprensió de la seva implicació en aquests processos. Entre els factors extrínsecs que modulen la microbiota, la dieta juga un paper molt important. En aquest estudi es van alimentar 750 corbines amb cinc dietes basades en fonts de proteïnes diferents [dieta control (DC), dieta de microalgues (DM), dieta de farina d'insectes (DIGUES), dieta de residus de l'enllaunat de la tonyina (DP.L) i dieta barreja de les tres anteriors (DMix)] i es van analitzar sis mostres de cada grup. Es va seqüenciar un fragment del gen 16S ARNr a través de la tecnologia MiSeq® de IIlumina®, i es va realitzar una anàlisi bioinformàtica amb l'eina QIIME2, i una anàlisi bioestadístico amb el paquet microressò de R. L'estudi va revelar que Mycoplasma, Enterobacter, Bacillus i Flavobacterium van ser els gèneres més abundants. El grup DM va mostrar un major índex de Shannon (H = 2,54 0,91). Segons les distàncies de Bray-*Curtis, les comparacions entre grups no van ser estadísticament significatives. Encara que els resultats entre les diferents dietes no van ser significatius, aquest estudi descriu per primera vegada la composició de la comunitat microbiana de l'intestí de la corbina.