Determinació de les proteïnes multifuncionals de Mycoplasma genitalium

Abstract

Les proteïnes moonlighting són proteïnes amb més d'una funció. Moltes estan implicades en malalties humanes i en són dianes de fàrmacs actuals. També s'ha vist que estan implicades en la virulència de microorganismes patògens. En aquest treball s'ha estudiat les proteïnes moonlighting d'un microorganisme patogen causant de malalties de transmissió sexual com la uretritis en homes i la cervicitis en dones, i associada a altres: Mycoplasma genitalium. L'anàlisi s'ha realitzat mitjançant eines bioinformàtiques, combinant cerques d'homologia remota (PSI-BLAST) amb bases de dades d'interactòmica (APID) juntament amb la recerca a altres bases de dades de proteïnes com UniProt i InterPro, ja que s'ha vist que era el mètode més eficaç en aquest cas. S'ha analitzat un 24.8% del proteoma conegut d'aquest bacteri i un 9.17% d'aquestes proteïnes analitzades han resultat ser moonlighting. Una d'elles és un factor de virulència conegut, fet que pot ser d'especial interès per a crear una vacuna contra aquest bacteri. En un futur, si s'acaba analitzant tot el proteoma de M. genitalium és molt probable que es descobreixin més proteïnes moonlighting que estiguin implicadesen la virulència d'aquest patogen. Ara bé, per facilitar aquesta tasca es podria millorar les eines bioinformàtiques que hi ha actualment per a realitzar aquest tipus anàlisi i fer-lo més eficaç.

Moonlighting proteins are proteins with more than one function. Many of them are involved in human disease and are targeted by current drugs. They are also involved in the virulence of pathogenic microorganisms. In this project is has been studied the moonlighting proteins of a pathogenic microorganism that causes sexually transmitted diseases such as urethritis in men and cervicitis in women, and associated with others: Mycoplasma genitalium. The analysis was performed using bioinformatics tools, combining remote homology searches (PSI-BLAST) with interactomics databases (APID) along with searching other protein databases such as UniProt and InterPro, as it has been shown to be the most effective method in this case. 24.8% of the known proteome of this bacterium has been analyzed and 9.17% of these proteins analyzed have been moonlighting. One of them is a known virulence factor, which may be of particular interest in creating a vaccine against this bacterium. In the future, if the entire M. genitalium proteome is to be analyzed, it is very likely that more moonlighting proteins will be discovered that are involved in the virulence of this pathogen. However, to facilitate this task, it would be useful to improve the current bioinformatics tools to carry out this type of analysis and make it more effective.

Las proteínas moonlighting son proteínas con más de una función. Muchas están implicadas en enfermedades humanas y son dianas de fármacos actuales. También se ha visto que están implicadas en la virulencia de microorganismos patógenos. En este trabajo se ha estudiado las proteínas moonlighting de un microorganismo patógeno causando de enfermedades de transmisión sexual como la uretritis en hombres y la cervicitis en mujeres, y asociada a otras: Mycoplasma genitalium. El análisis se ha realizado mediante herramientas bioinformáticas, combinando buscas de homología remota (PSI-BLASTO) con bases de datos de interactòmica (APID) junto con la investigación a otras bases de datos de proteínas como UniProt y InterPro, puesto que se ha visto que era el método más eficaz en este caso. Se ha analizado un 24.8% del proteoma conocido de esta bacteria y un 9.17% de estas proteínas analizadas han resultado ser moonlighting. Una de ellas es un factor de virulencia conocido, hecho que puede ser de especial interés para crear una vacuna contra esta bacteria. En un futuro, si se acaba analizando todo el proteoma de M. genitalium es muy probable que se descubran más proteínas moonlighting que estén implicadesen la virulencia de este patógeno. Ahora bien, para facilitar esta tarea se podría mejorar las herramientas bioinformáticas que hay actualmente para realizar este tipo análisis y hacerlo más eficaz.