Análisis de la implicancia de los miARN en el hepatocarcinoma aplicando minería de texto

Abstract

A través de la minería de texto, se ha logrado recopilar información proveniente de diferentes publicaciones, relacionadas con el hepatocarcinoma (HCC) y los miARN. A partir de acá se han obtenido genes que estarían implicados con esta enfermedad, miARN que juegan un papel importante y mutaciones que podrían conducir a la formación del HCC . El análisis realizado se visualiza a través de una aplicación web, HmiR², que fue llevada a cabo con el framework Shiny. Esta permite la integración con varias bases de datos que aportan información relevante sobre el contexto en el que se desarrolla esta enfermedad, como cuál es la función de los genes, cuál es el target al que se dirigen los miARN, qué tipo de mutaciones y dónde ocurren las mismas. Este trabajo podría funcionar como punto de partida hacia nuevas líneas de investigación que incluyan a los miARN y su participación en el cáncer.

Through text mining, it has been possible to collect information from different publications, related to hepatocarcinoma (HCC) and miRNAs. From here we have obtained genes that would be involved in this disease, miRNAs that play an important role and mutations that could lead to the formation of HCC. The analysis carried out is viewed through a web application, HmiR², which was carried out with the Shiny framework. This allows integration with several databases that provide relevant information about the context in which this disease develops,such as what is the function of genes, what is the target to which miRNAs are directed, what type of mutations and where they happen. This work could serve as a starting point for new lines of research that include miRNAs and their role in cancer.

A través de la mineria de text, s'ha aconseguit recopilar informació provinent de diferents publicacions, relacionades amb l'hepatocarcinoma (HCC) i els miARN. A partir d'aquí s'han obtingut gens que estarien implicats amb aquesta malaltia, miARN que juguen un paper important i mutacions que podrien conduir a la formació de l'HCC. L'anàlisi realitzada es visualitza a través d'una aplicació web, HmiR², que va ser portada a terme amb el framework Shiny. Aquesta permet la integració amb diverses bases de dades que aporten informació rellevant sobre el context en què es desenvolupa aquesta malaltia, com quina és la funció dels gens, quin és el target a què es dirigeixen els miARN, quin tipus de mutacions i on ocorren les mateixes. Aquest treball podria funcionar com a punt de partida cap a noves línies d'investigació que incloguin els miARN i la seva participació en el càncer.