Integrative analysis of methylation and expression data

Abstract

La metilación del DNA es un mecanismo epigenético directamente relacionado con la regulación génica, asociado al silenciamiento génico. Este tipo de regulación es especialmente importante en el desarrollo o en determinadas enfermedades como cáncer. En concreto se ha observado que la ganancia de metilación está relacionada con la regulación en cáncer de colón (CRC). Así pues, el aumento de la metilación y la disminución de la expresión forman un patrón en forma de L al representar los valores en un scatterplot. En este proyecto buscamos determinar la detección de genes potenciales en CRC en base al análisis de estos gráficos y a la clasificación en base a este patrón.

DNA methnylation is an epigenetic mecanism related with gene regulation. This type of genomic regulation is specially important in development or in some diseases such as Cancer. In particular, it has been observed an increase in the methylation levels related with the etiology of Colorectal Cancer(CRC). The rise in the methylation levels followed by a decrease of the expression creates a Lpattern in the scatterplot when those values are represented per gene. Our study is focus on the analysis of this pattern by the scagnostics.

La metilació del DNA és un mecanisme epigenètic directament relacionat amb la regulació gènica, associat al silenciament gènic. Aquest tipus de regulació és especialment important en el desenvolupament o en determinades malalties com càncer. En concret s'ha observat que el guany de metilació està relacionada amb la regulació en càncer de còlon (CRC). Així doncs, l'augment de la metilació i la disminució de l'expressió formen un patró en forma de L en representar els valors en un scatterplot. En aquest projecte busquem determinar la detecció de gens potencials en CRC d'acord amb l'anàlisi d'aquests gràfics i a la classificació d'acord amb aquest patró.