Ant colony optimization for predicting gene interactions from expression data

Abstract

Ant Colony Optimization is an algorithm from the Swarm Intelligence family that has been used for optimization problems including prediction of key gene interactions from expression data. In this Final Project, ACO has been modified and used for predicting more than key interactions in gene interaction networks from expression data.

Ant Colony Optimization és un algoritme basat en la intel·ligència d'eixam que s'ha utilitzat per a resoldre problemes d'optimització de grafs, incloent la predicció d'interaccions clau a partir de dades d'expressió gènica. En aquest Treball Final de Màster, ACO s'ha modificat i utilitzat per a la predicció d'interaccions clau en xarxes d'interacció gènica a partir de les dades d'expressió.

Ant Colony Optimization es un algoritmo basado en la inteligencia de enjambre que se ha utilizado para resolver problemas de optimización de grafos, incluyendo la predicción de interacciones clave a partir de datos de expresión génica. En este Trabajo Final de Máster, ACO se ha modificado y utilizado para la predicción de interacciones clave en redes de interacción génica a partir de los datos de expresión.