Eines bioinformàtiques aplicades a l'estudi de l'espermatozoide i el fluid seminal

Abstract

Aquest treball cerca per establir nous mètodes pel tractament de dades de proteòmica provinents de l'ús de TMT 10plex i cromatografia líquida seguida d'espectrometria de masses en tàndem (LC-MS/MS) i el seu estudi posterior, així com per l'estudi de RNAs i circRNAs d'espermatozoide provinents de la tecnologia d'alt rendiment, RNA-seq. En conclusió aquest treball s'aconsegueix crear un nou mètode per analitzar mostres de TMT seguides de LC-MS/MS amb problemes de quantificació i establir les bases per posar en marxa un punt de anàlisi bioinformàtic per a transcriptòmica.

This work seeks to establish new methods for the analysis of proteomic data derived from the use of TMT 10plex and liquid chromatography followed by tandem mass spectrometry (LC-MS / MS) and its subsequent study, and for the study of RNA and circRNAs of sperm derived from RNA-seq technology. In conclusion, this work achieves the creation of a new method for analyzing TMT data followed by LC-MS / MS with quantification problems and establishing the bases to launch a bioinformatic analysis for RN-seq data.

Este trabajo busca para establecer nuevos métodos por el tratamiento de datos de proteómica provenientes del uso de TMT 10plex y cromatografía líquida seguida de espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS) y su estudio posterior, así como por el estudio de RNAs y circRNAs de espermatozoide provenientes de la tecnología de alto rendimiento, RNA-seq. En conclusión este trabajo se consigue crear un nuevo método para analizar muestras de TMT seguidas de LC-MS/MS con problemas de cuantificación y establecer las bases para poner en marcha un punto de análisis bioinformàtic para transcriptòmica.