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http://hdl.handle.net/10609/81485
Title: Identificación de vías moleculares alteradas por mutaciones en kras y/o supervivencia en cáncer de colon
Author: Rodríguez Outeiriño, Lara
Director: Luna Cornadó, Jeroni
Tutor: Merino Arranz, David
Others: Universitat Oberta de Catalunya
Keywords: colon cancer adenocarcinoma
microARN
K-ras
survival
Issue Date: 5-Jun-2018
Publisher: Universitat Oberta de Catalunya
Abstract: In this study we show a comparative study of miRs's and mRNA's differentially expressed genes in patients with colon adenocarcinome (COAD), subdividing the sample by two criteria: KRAS mutational status and survival¿s rate. The interactions between overexpressed miRs and underexpressed mRNA in the disease are also shown. This can indicate genes that may play a role in COAD. Results can be used to find possible molecular predictors that would help us determine the relationship of tumours with KRAS mutation and/or survival rate. Using The Genome Cancer Atlas (TCGA) genomic information, miRs and mRNA counts were extracted, as well as clinical data. For computing bio statistical analysis, we use Bioconductor repository which use R statistical programming language in RStudio. Differential expression comparative searching for miRs-mRNA interaction and GO enrichment analysis was computed with the package miRComb.
Language: Spanish
URI: http://hdl.handle.net/10609/81485
Appears in Collections:Bachelor thesis, research projects, etc.

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DifExpr-ARNm-KRAS.txtResultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS3.2 MBTextView/Open
DifExpr-ARNm-Superv.txtResultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia1.59 MBTextView/Open
DifExpr-miRs-KRAS.txtResultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS81.48 kBTextView/Open
DifExpr-miRs-Superv.txtResultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia34.98 kBTextView/Open
Expr-ARNm-KRAS.txtResultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS196.82 MBTextView/Open
Expr-ARNm-Superv.txtResultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis de supervivencia47.61 MBTextView/Open
Expr-miRs-KRAS.txtResultados de expresión de miRs en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS6.11 MBTextView/Open
Expr-miRs-Superv.txtResultados de expresión de miRs en COAD para el análisis de supervivencia1.71 MBTextView/Open
GO-mutKRAS.txtResultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS129.49 kBTextView/Open
GO-superviencia.txtResultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según supervivencia25.62 kBTextView/Open
Top10-miRs-frecARNm-Superv.txtResultados top10 interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia166 BTextView/Open
Top10-miRs-namesARNm-Superv.txtResultados identificadores interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia54.19 kBTextView/Open
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