Aplicación web para el estudio del estado del arte en temas biomédicos aplicando técnicas de minería de textos

Abstract

Cualquier trabajo de investigación implica una búsqueda bibliográfica exhaustiva, a fin de identificar y localizar bibliografía sobre el tema en cuestión. Realizar manualmente el análisis de toda la información obtenida es una tarea tediosa y repetitiva que requiere de mucho tiempo y esfuerzo. El uso de una aplicación informática puede aligerar esta carga y facilitar el trabajo del investigador. Con este objetivo, el presente trabajo ha consistido en la elaboración de una aplicación web, utilizando el software libre R y distintos paquetes de minería de textos, que permite tabular la información obtenida tras una búsqueda en PubMed y presentarla en forma gráfica, lo que agiliza su análisis, al ser realizado con mayor rapidez y eficacia. Su estructura en bloques la hace de sencillo manejo, y la aplicación de métodos de minería de texto y estadística multivariante, permite la identificación de información útil e importante de los datos no estructurados de las sinopsis. Al poder compartirse en internet, la aplicación web puede ser utilizada por cualquier usuario, incluso aquellos sin conocimientos en lenguajes de programación. La aplicación está orientada al estudio de toxicidades en tratamientos de radioterapia para distintas localizaciones y se ha aplicado al tema específico "toxicidades en tratamientos de radioterapia de próstata".

Any research work involves a thorough bibliographic search, in order to identify and locate bibliography on the subject in question. A manually performed analysis of all available information is a tedious and repetitive task, challenging and time-consuming. Using a computer application can alleviate the burden and simplify the researcher's work. With this purpose, the present work consisted of the development of a web application, using the GPL software R and different text mining packages, allowing to tabulate the obtained information from a PubMed search and showing it graphically. This speed its analysis up, being performed more quickly and effective. Its structure in blocks, makes it use friendly, and the application of text mining methods and multivariate statistics, allows the extraction of useful and important information from the unstructured data of the abstracts. Sharing the application on the internet, makes it available for any user, even those without knowledge in programming languages. The application is aimed to the study of toxicities in radiotherapy treatments for different locations and has been applied to the specific topic "toxicities in prostate radiotherapy treatments".

Qualsevol treball d'investigació implica una recerca bibliogràfica exhaustiva, per tal d'identificar i localitzar bibliografia sobre el tema en qüestió. Realitzar manualment l'anàlisi de tota la informació obtinguda és una tasca tediosa i repetitiva que requereix de molt temps i esforç. L'ús d'una aplicació informàtica pot alleugerir aquesta càrrega i facilitar la feina de l'investigador. Amb aquest objectiu, el present treball ha consistit en l'elaboració d'una aplicació web, utilitzant el programari lliure R i diferents paquets de mineria de textos, que permet tabular la informació obtinguda després d'una cerca a PubMed i presentar-la en forma gràfica, el que agilitza la seva anàlisi, en ser realitzat amb més rapidesa i eficàcia. La seva estructura en blocs la fa de senzill maneig, i l'aplicació de mètodes de mineria de text i estadística multivariant, permet la identificació d'informació útil i important de les dades no estructurats de les sinopsi. En poder compartir a internet, l'aplicació web pot ser utilitzada per qualsevol usuari, fins i tot aquells sense coneixements en llenguatges de programació. L'aplicació està orientada a l'estudi de toxicitats en tractaments de radioteràpia per a diferents localitzacions i s'ha aplicat al tema específic "toxicitats en tractaments de radioteràpia de pròstata".