Identification and analysis of copper resistance and homeostasis genes in a new copper-tolerant Alteromonas macleodii bacterial strain

Abstract

The presented project shows a first approach to automatize the search of ortholog proteins and has analysed first obtained list of candidates generating interesting observations regarding copper-resistance systems representation in different bacterial strains. Both resistant strains of Alteromonas macleodii analyzed show higher number of copper-resistance related genes in their genome. The search for a conserved DNA sequence motif has given new insights into the transcriptional regulation mechanisms in Alteromonas macleodii species, which have been shown to be different from its Alteromonas counterparts.

El proyecto presentado muestra una primera aproximación para automatizar la búsqueda de proteínas ortólogas. También se ha analizado la primera lista de candidatos obtenida resultando en observaciones sobre la representación de los sistemas de resistencia a cobre en diferentes cepas bacterianas. Las dos cepas resistentes de Alteromonas macleodii analizadas muestran un número mayor de genes relacionados con resistencia al cobre en su genoma. La búsqueda del motivo de secuencia de ADN conservado a dado lugar a nuevas perspectivas en los mecanismos de regulación transcripcional en la especie Alteromonas macleodii, el cual ha mostrado ser diferente de otras especies que también pertenecen a las Alteromonas.

El projecte presentat mostra una primera aproximació per a automatitzar la cerca de proteïnes ortólogas. També s'ha analitzat la primera llista de candidats obtinguda resultant en observacions sobre la representació dels sistemes de resistència a coure en diferents ceps bacterians. Els dos ceps resistents de Alteromonas macleodii analitzades mostren un nombre major de gens relacionats amb resistència al coure en el seu genoma. La cerca del motiu de seqüència d'ADN conservat a donat lloc a noves perspectives en els mecanismes de regulació transcripcional en l'espècie Alteromonas macleodii, el qual ha mostrat ser diferent d'altres espècies que també pertanyen a les Alteromonas.