Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/120626
Títol: | 16SPyPrimer: un paquete en Python para el análisis de la cobertura de primers del gen 16S rRNA |
Autoria: | Vázquez González, Lara María |
Tutor: | Orengo, Dorcas |
Altres: | Prados Carrasco, Ferran |
Resum: | En diverses àrees com a microbiologia, ecologia o agricultura és important i necessari identificar adequadament les espècies bacterianes presents en una mostra qualsevol. Un exemple pot ser associar en un humà, animal o planta, una patologia concreta per la presència o no d'una espècie bacteriana concreta. En molts àmbits de la recerca sobre la diversitat bacteriana és necessari tenir la capacitat d'identificar grups concrets de bacteris i rebutjar altres grups per a diferents nivells taxonòmics. El gen 16S rRNA és d'ús habitual des de fa molts anys com a marcador filogenètic per a la identificació bacteriana, generalitzant-se el seu ús com a gen diagnòstic per a la identificació taxonòmica. En la literatura estan descrits molts parells d'engreixadors que funcionen adequadament per a les diferents zones conservades del gen 16S rRNA. No obstant això, se solen utilitzar engreixadors genèrics que no permeten seleccionar famílies o gèneres bacterians d'interès. En aquest treball es desenvolupa una eina en Python, anomenada 16SPyPrimer, que permet realitzar un anàlisi de la cobertura de parells d'engreixadors per a conjunts específics de bacteris. Aquest programari permet als investigadors modificar engreixadors ja coneguts per a trobar altres més específics segons les seves necessitats. Aquesta eina posseeix àmplies opcions configurables segons el criteri de l'usuari i retorna múltiples arxius de resultats amb la informació necessària per a realitzar anàlisis pròpies a posteriori. |
Paraules clau: | encebadors python cobertura |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | jun-2020 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
laravazquezgonzalezTFM0620memoria.pdf | Memoria del TFM | 979,32 kB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons