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http://hdl.handle.net/10609/126966
Título : | Comparative genomic analysis of CRISPR/Cas systems in Thermococcus genomes |
Autoría: | Blanch Asensio, Marc |
Tutor: | Pizarro Tobías, Paloma |
Otros: | Perez-Navarro, Antoni ![]() |
Resumen : | Los sistemas CRISPR/Cas son sistemas inmunes adaptativos extendidos en bacterias y arqueas que confieren protección contra ácidos nucleicos invasores. Sin embargo, más allá de su papel en procariotas, muchas aplicaciones se han derivado de estos sistemas, especialmente en el campo de la ingeniería del genoma. Tal ha sido el impacto de los sistemas CRISPR/Cas en este campo, que se consideran una tecnología revolucionaria. Este impacto ha impulsado el interés por identificar y caracterizar tales sistemas en procariotas. Aun así, los sistemas CRISPR/Cas de muchas procariotas, en particular en arqueas, siguen sin ser explorados. En el presente estudio, los sistemas CRISPR/Cas de Thermococcus se caracterizan mediante un análisis genómico comparativo. Thermococcus es un género de aqueas que comprende microorganismos termófilos. Este género presenta interés industrial, principalmente debido a sus enzimas termoestables. La caracterización de los sistemas identificados en Thermococcus reveló su presencia, diversidad, organización y elementos estructurales. Para dicha caracterización se ha requerido el uso de herramientas en línea, creadas especialmente para el análisis de los sistemas CRISPR/Cas, y de programas informáticos destinados a los análisis filogenéticos. En líneas generales, se ha detectado una elevada presencia y diversidad de sistemas CRISPR/Cas en Thermococcus. Los análisis de los CRISPR loci, cas loci y sus elementos estructurales también sugirieron probables eventos de transferencia horizontal de genes entre las especies de Thermococcus. Además, se ha generado un marco de trabajo para detectar y caracterizar los sistemas CRISPR/Cas en los genomas de procariotas, que puede emplearse para otras especies o géneros. |
Palabras clave : | CRISPR/Cas thermococcus características estructurales |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 5-ene-2021 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ ![]() |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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