Expresión diferencial de genes del cáncer gástrico en diferentes poblaciones: EAST vs. WEST: ¿posible efecto de la dieta?

Abstract

Se pretende realizar un estudio comparativo de expresión génica entre distintas poblaciones con cáncer gástrico e intentar establecer relaciones entre la expresión diferencial de genes y posibles factores de presión selectiva medioambiental y dietética. Materiales y métodos. Se estudia la expresión diferencial de genes en muestras de cáncer gástrico de distintas poblaciones, mediante el paquete edgeR del software R. Se estudian las diferencias clínicas y biológicas entre las poblaciones, y se intenta describir una relación plausible entre la expresión diferencial y los factores medioambientales y dietéticos mediante la búsqueda bibliográfica para establecer vías fisiológicas interrelacionadas. Resultados. En el estudio de expresión diferencial de genes, se incluyen un total de 71 muestras de 4 poblaciones distintas (latina, blanca, asiática y negra). Se describen diferencias significativas entre el tipo de tumor, el estadio en el momento del diagnóstico y la presencia de metástasis. Se describe la expresión diferencial de genes en las comparaciones 2 a 2 de las distintas poblaciones, destacando una expresión diferencial en los genes implicados en el metabolismo de las hormonas tiroideas y en el fenotipo de moléculas de histocompatibilidad, que podrían tener relación con factores de presión selectiva como la obesidad y la infección por Helicobacter pylori, respectivamente. Conclusiones. Se confirman diferencias significativas en el tipo histológico y el estadio en el momento del diagnóstico en distintas poblaciones, que presentan una expresión diferencial en genes que podrían estar modulados por efectos medioambientales y dietéticos como la obesidad y la infección por Helicobacter pylori.

Es pretén realitzar un estudi comparatiu d'expressió gènica entre diferents poblacions amb càncer gàstric i intentar establir relacions entre l'expressió diferencial de gens i possibles factors de pressió selectiva mediambiental i dietètica. Materials i mètodes. S'estudia l'expressió diferencial de gens en mostres de càncer gàstric de diferents poblacions, mitjançant el paquet edgeR del programari R. S'estudien les diferències clíniques i biològiques entre les poblacions, i s'intenta descriure una relació plausible entre l'expressió diferencial i els factors mediambientals i dietètics mitjançant la cerca bibliogràfica per a establir vies fisiològiques interrelacionades. Resultats. En l'estudi d'expressió diferencial de gens, s'inclouen un total de 71 mostres de 4 poblacions diferents (llatina, blanca, asiàtica i negra). Es descriuen diferències significatives entre la mena de tumor, l'estadi en el moment del diagnòstic i la presència de metàstasi. Es descriu l'expressió diferencial de gens en les comparacions 2 a 2 de les diferents poblacions, destacant una expressió diferencial en els gens implicats en el metabolisme de les hormones tiroidals i en el fenotip de molècules d'histocompatibilitat, que podrien tenir relació amb factors de pressió selectiva com l'obesitat i la infecció per Helicobacter pylori, respectivament. Conclusions. Es confirmen diferències significatives en el tipus histològic i l'estadi en el moment del diagnòstic en diferents poblacions, que presenten una expressió diferencial en gens que podrien estar modulats per efectes mediambientals i dietètics com l'obesitat i la infecció per Helicobacter pylori.

To compare gene expression between different populations with gastric cancer and to try to establish relationships between gene differential expression and possible environmental and dietary selective pressure factors. Materials and methods: The differential expression of genes in gastric cancer samples from different populations is studied using the edgeR package of the R software. Clinical and biological differences between populations are studied, and an attempt is made to establish a plausible relationship between differential expression and environmental and dietary factors by establishing interrelated physiological pathways. Results. The gene differential expression study includes a total of 71 samples from 4 distinct populations (latin, white, asian and black). Significant differences between tumor type, stage at diagnosis, and presence of metastasis are described. Gene differential expression is described in comparisons 2 to 2 of the different populations, highlighting a differential expression in genes involved in thyroid hormone metabolism and histocompatibility molecule phenotype, which could be related to selective pressure factors such as obesity and Helicobacter pylori infection, respectively. Conclusions. Significant differences in histological type and stage at diagnosis are confirmed in different populations, which have differential expression in genes that could be modulated by environmental and dietary effects such as obesity and Helicobacter pylori infection.