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http://hdl.handle.net/10609/146604
Título : | Development of Node- RED web-based, open- source visual workflow tool for bioinformatics |
Autoría: | Fàbregas Carreté, Ferran |
Tutor: | Ortega-Carrasco, Elisabeth |
Otros: | Perez-Navarro, Antoni |
Resumen : | Las herramientas bioinformáticas se han convertido en un elemento clave en el desarrollo actual de la genómica, en gran medida gracias a la implicación de instituciones públicas, centros de investigación, empresas privadas y particulares, lo que ha propiciado la aparición de una gran cantidad y variedad de aplicaciones. En este PTM, desarrollamos un software bioinformático para el diseño visual de flujos de trabajo de datos genómicos en un entorno web basado en Node-RED, incorporando funcionalidades relacionadas con la genómica como la lectura y escritura de ficheros de datos genómicos, la gestión de secuencias, el tratamiento y el análisis, con el objetivo de diseñar una herramienta abierta, flexible e interdisciplinar con una curva de aprendizaje moderada que aproveche las funcionalidades nativas de la plataforma Node-RED y, sobre todo, que sea útil no sólo para la comunidad bioinformática sino también para la comunidad educativa. Por ello, no sólo se ha desarrollado la herramienta software principal, sino que se ha publicado un conjunto de utilidades, como una plataforma de gestión de incidencias, una lista de correo con un foro abierto, la publicación del código fuente como open-source, y el propio software empaquetado, además de su correspondiente documentación. En conclusión, se ha tratado de poner a disposición de la comunidad bioinformática una nueva herramienta integradora de gran utilidad que aporta un nuevo enfoque, tanto a nivel técnico como conceptual, gracias a su innovadora arquitectura, la implementación de flujos de trabajo, la sencillez de uso, y su integración con otros servicios no bioinformáticos, con el añadido de ser una herramienta basada en código abierto, permitiendo así su constante evolución por parte de cualquier miembro de la comunidad bioinformática. |
Palabras clave : | Javascript flujo de trabajo kit de herramientas visuales |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 2-jun-2022 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Ficheros en este ítem:
Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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ffabregasFMDP0622report.pdf | Report of TFM | 2,26 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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