Projecte Borges plus

Abstract

The aim of the Borges plus project is to develop a prototype based on a columnar DB over a distributed network with SQL declarative language. A new vectorial formalism is used to describe backbone conformation and geometrical relations among secondary structure elements. This system, with high performance and Big Data capabilities will be at the heart of software developed at the IBMB-CSIC to solve protein structures and will be operative on the local network and portable to supercomputing facilities such as the Gordon supercomputer in San Diego (SDSC).

L'objectiu del projecte Borges Plus és desenvolupar un prototip per al programa Borges, basat en una base de dades columnar distribuïda en xarxa i llenguatge declaratiu SQL. Aquest prototip, una BD amb capacitat de Big Data, es situarà al cor del programari desenvolupat per l'IBMB-CSIC per tal d'ajudar a resoldre estructures de proteïnes i serà operatiu en xarxa local i exportable a instal·lacions de supercomputació com la Gordon de San Diego (SDSC) als EEUU.

El objetivo del proyecto Borges Plus es desarrollar un prototipo para el programa Borges, basado en una base de datos columnar distribuida en red y lenguaje declarativo SQL. Este prototipo, una BD con capacidad de Big Data, se situará en el corazón del software desarrollado por el IBMB-CSIC con el fin de ayudar a resolver estructuras de proteínas y será operativo en red local y exportable a instalaciones de supercomputación como la Gordon de San Diego (SDSC) en los EEUU.