Predicción de la toxicidad y de la actividad antimicrobiana a partir de la secuencia aminoacídica

Abstract

Vimos la necesidad de crear una herramienta informática que pudiera predecir la actividad antimicrobiana y si pudiera causar toxicidad de un péptido. ¿Por qué era importante? Porque hay un creciente problema con la resistencia bacteriana a los antibióticos, que conlleva que cada vez hay menos moléculas que podrán utilizarse contra las infecciones problemáticas y, por lo tanto, es importante crear o descubrir nuevos fármacos con una fuerte actividad antibacteriana. Para ello, creamos dos modelos SVM, uno que clasifique entre péptidos tóxicos y no tóxicos, y otro que puede detectar si un péptido tiene actividad antimicrobiana, o no.

We saw a necessity to create a informatic tool which it could predict the antimicrobial activity and if it could cause a toxic effect. Why it was important? Because there is problem with the bacterial resistance to antibiotics. Actually, there are less molecules that it could be used in the problematic infections and it is hardly important to create or discover new drugs with a strong antibacterial activity.

Vam veure la necessitat de crear una eina informàtica que pogués predir l'activitat antimicrobiana i si pogués causar toxicitat d'un pèptid. Per què era important? Perquè hi ha un creixent problema amb la resistència bacteriana als antibiòtics, que comporta que cada vegada hi ha menys molècules que podran utilitzar-se contra les infeccions problemàtiques i, per tant, és important crear o descobrir nous fàrmacs amb una forta activitat antibacteriana. Per a això, vam crear dos models SVM, un que classifiqui entre pèptids tòxics i no tòxics, i un altre que pot detectar si un pèptid té activitat antimicrobiana, o no.