Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
http://hdl.handle.net/10609/74347
Título : | Visualización mediante shiny de la calidad de los datos de RNA-Seq relacionados con el sistema inmune y el cáncer |
Autoría: | Ferrer Torres, Adrián |
Tutor: | Gonzalo Sanz, Ricardo |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Morán Moreno, Jose Antonio Ventura, Carles |
Resumen : | Debido al alza en la incidencia del cáncer en la población, ha llegado a ser la segunda causa de muerte en el mundo. Por ello, el estudio del sistema inmune relacionado con esta enfermedad es prioritario, investigar en qué falla y cómo se modifica la expresión de las células linfocíticas. Así se ganaría información acerca de la evasión inmune llegando a poder reconocer posibles checkpoints o dianas farmacológicas en las que actuar con diferentes tipos de fármacos, inmunoterapias u otras terapias personalizadas posibles. Para poder analizar la expresión génica es preciso primero realizar un pre-filtrado, control y normalización de los resultados obtenidos por las muestras de un estudio RNA-seq. Esto es lo que se pretende en este estudio, mostrando además las diferentes etapas de los resultados obtenidos con gráficos y tablas en una aplicación hecha con el paquete shiny. Las muestras se obtuvieron de la página web de gene expression omnibus. Se utilizó el paquete edgeR así como DT entre otros para la construcción de la aplicación. Además se incluye en la memoria: el informe del presupuesto para un pequeño laboratorio y centro de investigación que secuencie el genoma de los clientes y que realice también otros estudios derivados de las ciencias ómicas de otros centros como hospitales, institutos y centros de investigación. |
Palabras clave : | RNAseq Shiny expresión génica control de calidad |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | feb-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Ficheros en este ítem:
Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
---|---|---|---|---|
GSM2461003_LAU125.genes.results.txt | 4,81 MB | Text | Visualizar/Abrir | |
GSM2461005_LAU355.genes.results.txt | 4,81 MB | Text | Visualizar/Abrir | |
GSM2461007_LAU1255.genes.results.txt | 4,81 MB | Text | Visualizar/Abrir | |
GSM2461009_LAU1314.genes.results.txt | 4,81 MB | Text | Visualizar/Abrir | |
Visualización de la calidad de los datos de RNA-Seq relacionados con el sistema inmune y el cáncer visualizados mediante shiny.ppsx | 4,69 MB | Unknown | Visualizar/Abrir | |
adrianferrertTFM0118memoria.pdf | Memoria del TFM | 1,1 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
Comparte:
Este ítem está sujeto a una licencia Creative Commons Licencia Creative Commons