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http://hdl.handle.net/10609/82005
Título : | Determinación de marcas epigenéticas específicas de tejido para la identificación del origen de las vesículas circulantes |
Autoría: | Martínez Micaelo, Neus |
Tutor: | Brunel, Helena |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resumen : | El presente Trabajo Final de Máster (TFM) pretende dar respuesta a la necesidad de identificar el origen de las vesículas extracelulares circulantes. Así teniendo en cuenta que las vesículas extracelulares contienen material genético de la célula progenitora, incluyendo ADN genómico, y que cada tipo celular tiene un patrón epigenético específico, el objetivo principal de este TFM es la aplicación de métodos y herramientas bioinformáticas en datos epigenéticos depositados en bases de datos públicos, para el diseño y el desarrollo de un algoritmo clasificador de marcadores epigenéticos capaz de diferenciar entre tejidos. Para alcanzar el objetivo principal se han analizado los datos referentes a la metilación de DNA de un total de 252 experimentos, agrupados en 24 clústers específicos de tejido o tipo celular, y mediante la creación de una función (BiosourceMapper) se han identificado posiciones o loci diferencialmente metilados para el tejido o tipo celular seleccionado, así como las regiones enriquecidas en posiciones diferencialmente metiladas. Además para mejorar la visualización e interpretación de los datos se ha creado la aplicación shiny Biosource Mapper App, que permite poden acceder y analizar los resultados generados durante este TFM a cualquier usuario. La principal conclusión obtenida es que mediante el análisis bioinformático del patrón de metilación con la función BiosourceMapper implementada en la aplicación Biosource Mapper App es posible obtener marcas específicas de tejido. |
Palabras clave : | vesículas extracelulares epigenética |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 5-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Ficheros en este ítem:
Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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neusmartinezTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 4,77 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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