Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/83085
Títol: | Análisis transcriptómico asociado a la producción de betacaroteno en Yuca |
Autoria: | Ovalle Rivera, Tatiana Melissa |
Tutor: | Pantano Rubiño, Lorena |
Altres: | Marco-Galindo, Maria-Jesús |
Resum: | La desnutrició afecta a milions de persones, principalment a causa que els cultius crítics per a la seguretat alimentària contenen baixos nivells de micronutrientes. La yuca (Manihot esculenta Crantz) és l'aliment bàsic de més de 500 milions de persones i els programes de millorament s'han enfocat a augmentar els nivells de b-caroteno en les arrels. Amb la finalitat de recolzar els processos de millorament, l'objectiu d'aquest treball va consistir a identificar l'expressió i comprendre que proporció del genoma s'activa en la producció elevada d'aquest compost. Per a això, sis genotips d'una família de segregació, i els dos progenitors es van escollir per dur a terme la seqüenciació del RNA. La plataforma bioinformàtica per a aquest estudi va incloure: Mapatge amb HISAT2, assemblatge del transcriptoma amb StringTie, quantificació de l'expressió amb Kallisto, expressió diferencial amb DESeq2 i DEGreport per mostrar els resultats. Finalment, l'anotació, funció i regulació es va obtenir a partir del portal PlantRegMap. Els resultats obtinguts van mostrar que les regions del genoma que se sobri-expressen durant l'acumulació de b-caroteno estan relacionades amb la resposta a estrès per calor, per temperatura i intensitat lumínica i en cas de no acumular-se b-caroteno es presenten una diversitat de rutes de síntesis actives en la qual es destaca la síntesi de esteroles. Addicionalment 3 gens reguladors van ser identificats en el transcriptoma d'arrel i 42 gens pel transcriptoma de fulla. L'ús de la informació generada en aquest estudi presenta múltiples implicacions per al programa de millorament i millora la comprensió de l'acumulació del b-caroteno en l'arrels de yuca. |
Paraules clau: | RNA-seq bioinformàtica betacarotè |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 13-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
tovalleTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 4,11 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons