Estudio de genómica comparada de genes bacterianos relacionados con la proliferación en la rizosfera

Abstract

Pseudomonas is a taxonomically diverse genus that harbors one of the most studied species for its mutualistic relationship with plants at the rhizosphere level, Pseudomonas putida. It is considered a rhizobacteria that promotes plant growth, also knows as a PGPR (Plant-Growth Promoting Rhizobacteria). The different stages of colonization have been defined, being the adhesion, the biosynthesis of flagella and the adaptation to stress, essential characteristics to carry out an optimal colonization of the rhizosphere, as well as the genes involved in the different stages of colonization. The RpoN and FliA genes have been described as genes involved in biosynthesis, the RelA gene is related to stress adaptation and the GalU gene is described as involved in the later stages of colonization. This work carries out a study on selection by comparative genomics, determining the relationship between the structure and the function of the genes RpoN, FliA, RelA and GalU, through the different species and strains of Pseudomonas.

Pseudomonas es un género taxonómicamente muy diverso que alberga una de las especies más estudiada por su relación mutualista con las plantas a nivel de la rizosfera, Pseudomonas putida. Está considerada una rizobacteria que promueve el crecimiento de la planta, también conocida como una PGPR (Plant-Growth Promoting Rhizobacteria). Se han definido las distintas etapas de colonización, siendo la adhesión, la biosíntesis de flagelos y la adaptación al estrés, características esenciales para llevar a cabo una colonización óptima de la rizosfera, así como los genes implicados las distintas etapas de la colonización. Los genes RpoN y FliA han sido descritos como genes implicados en la biosíntesis, el gen RelA está relacionado con la adaptación al estrés y el gen GalU se describe implicado en las etapas más tardías de la colonización. Este trabajo lleva a cabo un estudio sobre la selección mediante la genómica comparada, determinando la relación entre la estructura y la función de los genes RpoN, FliA, RelA y GalU, a través de las distintas espécies y cepas de Pseudomonas.

Pseudomonas és un gènere taxonómicament molt divers que alberga una de les espècies més estudiada per la seva relació mutualista amb les plantes a nivell de la rizosfera, Pseudomonas putida. Està considerada una rizobacteria que promou el creixement de la planta, també coneguda com una PGPR (Plant- Growth Promoting Rhizobacteria). S'han definit les diferents etapes de colonització, sent l'adhesió, la biosíntesi de flagels i l'adaptació a l'estrès, característiques essencials per a dur a terme una colonització òptima de la rizosfera, així com els gens implicats les diferents etapes de la colonització. Els gens RpoN i FliA han estat descrits com a gens implicats en la biosíntesi, el gen RelA està relacionat amb l'adaptació a l'estrès i el gen GalU es descriu implicat en les etapes més tardanes de la colonització. Aquest treball duu a terme un estudi sobre la selecció mitjançant la genòmica comparada, determinant la relació entre l'estructura i la funció dels gens RpoN, FliA, RelA i GalU, a través de les diferents espécies i ceps de Pseudomonas.