Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/96847
Títol: | Desarrollo de un pipeline bioinformático mediante R: análisis basados en panel de cáncer de pulmón |
Autoria: | Masip Galaso, David |
Tutor: | Rebrij, Romina |
Altres: | Merino, David |
Resum: | En l'actualitat, el càncer de pulmó és un dels tipus de càncer més comuns i dels més extensos. En comparació amb la resta de càncers, al voltant del 14% de tots els càncers nous són càncers procedents d'aquest òrgan. A causa de les altes estadístiques, es creu interessant fer el present treball de fi de màster amb la realització d'un pipeline bioinformàtic a partir d'un panell de gens de càncer de pulmó. Per a això, es parteix d'una base amb dades tipus Fastq files procedent d'un panell de gens per a la posterior parametrització [1] [2] [3] [4]. Amb el present objectiu i en plena expansió i integració genòmica en el camp del diagnòstic clínic, trobem una raó de pes per a l'execució d'aquest particular estudi dins el camp de diagnòstic. El tipus de llenguatge utilitzat per a aquest projecte serà la plataforma de programari lliure R i els seus diferents paquets de Bioconductor utilitzats al llarg del pipeline, els quals ens permetran filtrar i definir amb gran detall tota la informació provinent dels arxius seleccionats, treure dades estadístiques representar d'una forma ràpida, simple, coherent i de la millor manera possible. Aquesta aplicació es pot utilitzar per a qualsevol tipus d'estudi sempre que el punt d'inici sigui una base amb dades de classe fastq files, ja sigui precedent de Pubmed, de qualsevol tipus de panell de gens procedents d'un seqüenciador o de qualsevol altra font. Aquesta a més pot ser utilitzada per qualsevol usuari, fins i tot aquells sense coneixements en llenguatges de programació específic. |
Paraules clau: | FASTQ files càncer de pulmó mineria de dades |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 20-jun-2019 |
Llicència de publicació: | http://www.gnu.org/licenses/gpl.html |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
dmasipgTFM0619memoria.pdf | Memoria del TFM | 2,8 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
dmasipgTFM0619presentación.pdf | Presentación del TFM | 2,34 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Els ítems del Repositori es troben protegits per copyright, amb tots els drets reservats, sempre i quan no s’indiqui el contrari.