Estudio genómico de schwannomas esporádicos y schwannomas asociados a neurofibromatosis tipo 2

Abstract

Los schwannomas son tumores benignos formados por células de Schwann que rodean a los nervios mielínicos. Pueden surgir de manera esporádica o como consecuencia de ciertos síndromes genéticos (como neurofibromatosis tipo 2). Hoy día no existe ningún tratamiento eficaz para esta patología y los mecanismos moleculares implicados no están completamente entendidos. Se han encontrado mutaciones en el gen NF2 en diferentes tipos de schwannomas, por lo que es posible que tenga un papel central en su desarrollo, aunque otros genes podrían estar implicados. Las técnicas de NGS, como whole exome sequencing, pueden ser de gran utilidad para la búsqueda de posibles marcadores moleculares y dianas terapéuticas que puedan mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes, así como nuestro entendimiento de los mecanismos moleculares implicados. El objetivo principal de este trabajo fue detectar genes mutados que puedan favorecer el crecimiento de este tipo de tumores, utilizando datos obtenidos mediante WES de muestras de schwannomas esporádicos y asociados a neurofibromatosis tipo 2. Para ello, se utilizaron diferentes herramientas bioinformáticas mediante un protocolo diseñado específicamente para este trabajo. Los resultados mostraron que los schwannomas esporádicos pueden requerir de más mutaciones para su desarrollo y que los genes mutados en ambos tipos de schwannomas participan en procesos biológicos diferentes, lo cual sugiere que cada tipo de schwannoma podría seguir mecanismos moleculares diferentes para su desarrollo. Además, el gen NF2, se encontró mutado en la mayoría de las muestras indicando que puede tener un papel central, aunque otros genes podrían estar implicados (como PABPC3).

Els schwannomas són tumors benignes formats per cèl·lules de Schwann que envolten als nervis mielínics. Poden sorgir de manera esporàdica o com a conseqüència de certes síndromes genètiques (com a neurofibromatosis tipus 2). Avui dia no existeix cap tractament eficaç per a aquesta patologia i els mecanismes moleculars implicats no estan completament entesos. S'han trobat mutacions en el gen NF2 en diferents tipus de schwannomas, per la qual cosa és possible que tingui un paper central en el seu desenvolupament, encara que altres gens podrien estar implicats. Les tècniques de NGS, com whole exome sequencing, poden ser de gran utilitat per a la cerca de possibles marcadors moleculars i dianes terapèutiques que puguin millorar el diagnòstic i el tractament dels pacients, així com el nostre enteniment dels mecanismes moleculars implicats. L'objectiu principal d'aquest treball va ser detectar gens mutats que puguin afavorir el creixement d'aquest tipus de tumors, utilitzant dades obtingudes mitjançant WES de mostres de schwannomas esporàdics i associats a neurofibromatosis tipus 2. Per a això, es van utilitzar diferents eines bioinformáticas mitjançant un protocol dissenyat específicament per a aquest treball. Els resultats van mostrar que els schwannomas esporàdics poden requerir de més mutacions per al seu desenvolupament i que els gens mutats en tots dos tipus de schwannomas participen en processos biològics diferents, la qual cosa suggereix que cada tipus de schwannoma podria seguir mecanismes moleculars diferents per al seu desenvolupament. A més, el gen NF2, es va trobar mutat en la majoria de les mostres indicant que pot tenir un paper central, encara que altres gens podrien estar implicats (com PABPC3).

Schwannomas are benign tumors composed by Schwann cells of nerves sheaths. They can arise spontaneously or as consequence of several genetic syndromes (for example neurofibromatosis type 2). Today there is not a completely effective treatment for this pathology and the molecular pathways involve are not fully understood. Mutations in NF2 gene have been found in different types of schwannomas and it could have a main role in the development of these tumors, although other genes may be implicated too. NGS technology, as for example, the whole exome sequencing, can be of great help in the seek for news molecular and therapeutic targets, improving the diagnostic and treatment of patients as well as our understanding of molecular pathways involved. The principal aim of this project was to find mutated genes related with the growing of these kinds of tumors, using data obtained from WES of sporadic and neurofibromatosis type 2 related schwannomas samples. Different bioinformatics tools were used, and a specific pipeline was designed to perform the analysis. Results suggest that sporadic schwannomas could need a greater number of mutations for their development and mutated gene found in sporadic and neurofibromatosis type 2 related schwannomas are involved in different biological process, suggesting that distinct molecular pathways are implicated in their development. In addition, NF2 gene was found altered in most of the samples showing it can have a main role, although other genes could have an important function, as PABPC3.