Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/81671
Títol: | Desarrollo de un proceso de análisis de datos RNA-seq, para el estudio de la expresión diferencial en distintos puntos en el tiempo |
Autoria: | Magallón Lorenz, Miriam |
Tutor: | Gel Moreno, Bernat |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Ventura, Carles |
Resum: | L'objectiu d'aquest projecte va ser desenvolupar un procés d'anàlisi de dades de RNA-seq, per estudiar les dades procedents de l'estudi de diferenciació en diferents punts en el temps. Amb l'ús de paquets de R i Bioconductor , com DESeq2,es van implementar diferents funcions, prenent com a referència les preguntes plantejades per les investigadores, per respondre-les d'una manera més precisa i adequada. Com a resultat, es van obtenir unes funcions capaces de realitzar una anàlisi d'expressió diferencial clàssic, així com respondre a altres qüestions que s'havien plantejat, com observar l'expressió d'un gen al llarg del temps. Per comprovar els mètodes desenvolupats es van analitzar les mostres procedents de fibroblastos (FiPS), utilitzades com a control. Es va comprovar que el procés de diferenciació de cèl·lules de Schwann es va produir de la manera esperada. A més, es van trobar nous possibles marcadors dels diferents estadis de diferenciació usant les funcions implementades. En conclusió, les diferents funcions implementades funcionaven satisfactòriament i es van respondre a les preguntes plantejades de manera apropiada. |
Paraules clau: | RNA-seq DESeq2 anàlisi de dades |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 5-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
mmagaloTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 2,95 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons