Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/96346
Títol: | Estudio de genómica comparativa de genes bacterianos relacionados con la ruta catabólica inferior del naftaleno: metabolismo del salicilato |
Autoria: | Zarandona Garai, Aitor |
Tutor: | Pizarro Tobías, Paloma |
Altres: | Merino, David |
Resum: | L'objectiu d'aquest estudi és fer una anàlisi de genòmica comparativa dels gens bacterians relacionats amb la ruta catabòlica inferior del naftalè: la ruta del salicilat. El naftalè és un dels hidrocarburs policíclics aromàtics (PAH) més contaminant del planeta. Aquest compost químic és molt complicat de degradar, però, hi ha bacteris, algues i fongs capaços de metabolitzar. Aquest treball es focalitza en l'enzim salicilat hidroxilasa (EC: 1.14.13.1), la qual catalitza la conversió salicilat a catecol. La seva seqüència codificant es troba en el plasmidi NAH7 del microorganisme Pseudomonas putida G7, una de les espècies degradadores de PAHs més estudiades. Partint de la seqüència aminoacídica es realitza una recerca BLAST amb l'objectiu de trobar proteïnes homòlogues. La comparació d'aquestes seqüències es realitza mitjançant un alineament múltiple i la creació d'arbres filogenètics. L'últim pas es basa en conèixer la localització dels gens i si es tracten d'unitats transcripcionals o formen part d'un operó. Es comparen els operons amb el mateix nombre de gens. BLAST, MEGAX, FGENESB, i SnapGene són algunes de les eines bioinformàtiques utilitzades durant el treball. Els resultats obtinguts de l'estudi guien a una conclusió: el gen que codifica l'enzim salicilat hidroxilasa no és part d'un operó altament conservat. |
Paraules clau: | biodegradació genòmica comparada naftalè |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 4-jun-2019 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
zaran1905TFM0619memoria.pdf | Memoria del TFM | 2,38 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons