Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/132610
Títol: | Obtención de driver genes para subtipado en Colon adenocarcinoma mediante la integración de datos ómicos |
Autoria: | Martínez Quiroga, Sharon |
Tutor: | Sastre Tomas, Jaume |
Altres: | Maceira, Marc |
Resum: | En els últims anys s'ha abaratit els costos de la generació de dades òmics, cosa que ha impulsat a estudiar-los en el seu conjunt per poder avançar fins a una medicina personalitzada. Avui dia, la integració de dades ens està permetent estudiar per a les patologies seus subtipus, biomarcadors, i possibles medicaments o les seves combinacions. L'objectiu d'aquest TFM és conèixer i aplicar els nous mètodes d'integració de dades disponibles, i comparar els seus resultats amb els de les anàlisis de òmiques independents. A més, es veurà part de les seves múltiples aplicacions. S'integrarà dades de genòmica, metilómica i transcriptòmica mitjançant iClusterBayes, un mètode d'última generació que ha demostrat tenir la mateixa qualitat que els seus predecessors però que estalvia molt de temps. A més, s'integraran pathways i altres dades disponibles en repositoris podent-se veure el gran potencial de la integració de dades. S'analitzarà dades de Adenocarcinoma de Colon (Coad) procedents de el projecte TCGA. Els resultats de la integració, molt diferents als d'anàlisi independents, van mostrar que el Coad té 5 subtipus. Es van obtenir 1028 gens amb CNA, 331 gens amb metilació diferencial i 3073 gens amb expressió diferencial que actuen com driver gens d'aquesta patologia. A més, es va observar que les rutes més afectades en la patologia estan relacionades amb l'homeòstasi i el desenvolupament. |
Paraules clau: | integració de dades òmiques eines per a integració de multi-òmiques subtipat |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 29-jun-2021 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
smartinezqTFM0621memoria.pdf | Memoria del TFM | 2,31 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons