Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/133068
Títol: | Análisis filogenético de la óxido nítrico reductasa (Nor): establecimiento del perfil de la proteína |
Autoria: | Valverde Guirao, Ana Belén |
Tutor: | Pizarro Tobías, Paloma |
Altres: | Perez-Navarro, Antoni |
Resum: | La finalitat d'aquest treball va ser la realització d'una anàlisi filogenètic, així com la construcció de l'perfil de la proteïna òxid nítric reductasa (Nor). Aquest enzim contribueix a la formació d'un potent gas d'efecte hivernacle, l'òxid nitrós (N2O), que participa en la destrucció de la capa d'ozó. El punt de partida de l'estudi va ser la creació d'una base de dades de proteïnes Nor bacterianes mitjançant PSI-BLAST. La metodologia portada a terme en aquest treball es va basar en l'ús de diferents eines bioinformàtiques com MEGA-X, ModelTest o TREE-PUZZLE per a l'anàlisi filogenètic, així com HMMER per a la construcció de l'perfil. A més, es va utilitzar R per a la creació de petits programes que van ajudar a continuar amb l'estudi, a més d'altres programes. Els resultats obtinguts van mostrar que l'arbre resultant agrupava les seqüències en dos clados diferents. En un d'ells predominaven bacteris de la família Rhizobiaceae, mentre que, en l'altre, la majoria eren de l'ordre Rhodobacterales. D'altra banda, es va veure que els perfils obtinguts eren capaços de reconèixer proteïnes anotades com Nor en una base de dades de proteïnes, així com proteïnes denotades com unclassified. Els resultats van apuntar al fet que els perfils podrien usar-se per seguir estudiant el paper que té l'enzim Nor en augment dels nivells de N2O atmosfèric. D'aquesta manera, es podrien dur a terme diferents abordatges per mitigar aquest greu problema a nivell mediambiental. |
Paraules clau: | anàlisi filogenètica perfil proteic |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | jun-2021 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
avalverdeguiTFM0621memoria.pdf | Memoria del TFM | 1,68 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons