Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/138687
Títol: | Classification between odorant and gustatory receptors: Supervised learning applied to arthropod proteins |
Autoria: | Enríquez Romero, Félix Francisco |
Tutor: | Orengo, Dorcas |
Altres: | Calvet Liñán, Laura |
Resum: | La caracterització funcional de proteïnes és difícil d'aconseguir mitjançant sistemes automàtics basats en alineaments de seqüències. Aquests sistemes no han trobat evidència que receptors olfactoris siguin presents en artròpodes no insectes. En aquest projecte es desenvolupa un sistema basat en aprenentatge supervisat que primerament sigui capaç de classificar la funcionalitat de proteïnes provinents d'insectes en receptors de tipus olfactori i receptors de tipus gustatiu i que posteriorment pugui identificar en seqüències d'altres artròpodes (anotades com a receptors gustatius per sistemes d'alineament de seqüències) seqüències que hagin sofert una divergència funcional similar a l'ocorreguda en els insectes alats fa uns 440 milions d'anys. Les seqüències que conformen el dataset es van obtenir de UniProtKB, tres mètodes diferents van ser usats per a codificar les seqüències i poder entrenar tres xarxes neuronals artificials. Els resultats assolits confirmen l'eficàcia del model dut a terme amb un AUC, precisió i F1 de 0.911, 0.971 i 0.926, respectivament. Es va aconseguir un llistat de seqüències candidates a tenir una funcionalitat semblant a receptors olfactoris en artròpodes no insectes. L'anàlisi posterior de la funcionalitat d'aquestes seqüències podria corroborar les prediccions del model. La troballa de la presència de proteïnes amb funcionalitat semblant als receptors olfactoris seria indicatiu d'una possible convergència evolutiva. |
Paraules clau: | receptor d'olors receptor gustatiu aprenentatge supervisat |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 1-gen-2022 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/es |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
fferTFM0122presentationvideo.mp4 | Presentation Video | 68,68 MB | MP4 | Veure/Obrir |
fferTFM0122memory.pdf | TFM Memory | 700,44 kB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons