MethylExplorer: buscador de estudios de metilación de ADN

Abstract

Los estudios de metilación de ADN generan gran cantidad de datos que se almacenan en distintos repositorios, y en general se publican como datos abiertos. MethylExplorer localiza este tipo de datos en tres de estos repositorios (GEO, ArrayExpress y GDC), y de forma centralizada permite obtener y analizar algunos de ellos. La aplicación está desarrollada con Shiny y R, y se puede desplegar en el servidor Shiny Server, de forma que sea accesible de forma remota.

DNA methylation studies generate large amounts of data that are stored in different repositories, and are generally published as open data. MethylExplorer locates this type of data in three of these repositories (GEO, ArrayExpress and GDC), and centrally allows to obtain and analyze some of them. The application is developed with Shiny and R, and can be deployed on the Shiny Server, so that it is accessible remotely.

Els estudis de metilación d'ADN generen gran quantitat de dades que s'emmagatzemen en diferents repositoris, i en general es publiquen com a dades obertes. MethylExplorer localitza aquest tipus de dades en tres d'aquests repositoris (GEO, ArrayExpress i GDC), i de forma centralitzada permet obtenir i analitzar alguns d'ells. L'aplicació està desenvolupada amb Shiny i R, i es pot desplegar en el servidor Shiny Server, de manera que siga accessible de forma remota.