Ontologías para el modelado y el análisis de microRNAs

Abstract

Los miRNA son secuencias de RNA no codificante de unos 19-25nt, en muchos casos conservadas entre especies, que tienen un importante papel en la regulación génica. En contraste con el gran número de herramientas computacionales, no existe todavía una ontología que sea capaz de representar todos los conceptos relacionados con los miRNA. El objetivo de este proyecto es la extensión de una ontología de miRNA (y sus dianas) para el modelaje y estudio de los miARN; además de conseguir una plataforma computacional que permita realizar consultas a dicha ontología.

Els miRNA són seqüències de RNA no codificante d'uns 19-25nt, en molts casos conservades entre espècies, que tenen un important paper en la regulació gènica. En contrast amb el gran nombre d'eines computacionals, no existeix encara una ontologia que siga capaç de representar tots els conceptes relacionats amb els miRNA. L'objectiu d'aquest projecte és l'extensió d'una ontologia de miRNA (i les seues dianes) per al modelaje i estudi dels miARN; a més d'aconseguir una plataforma computacional que permeta realitzar consultes a aquesta ontologia.

miRNAs are non-coding RNA sequences of 19-25nt, in many cases conserved across species, which have an important role in gene regulation. In contrast to the large number of computational tools, there is not yet an ontology that is able to represent all concepts related to miRNA. The objective of this project is to extend an ontology about miRNA (and its targets) for the modeling and study of concepts about miRNAs. In addition, another goal is to obtain a computational platform that allows making queries to the extended ontology.