Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/73565
Títol: | Estudio comparativo de modelos de machine learning para la detección de dianas microARN |
Autoria: | Martínez Martínez, Jordi |
Tutor: | Pla Planas, Albert |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Morán Moreno, Jose Antonio Ventura, Carles |
Resum: | Els microARN són petites molècules de ARN d'una longitud aproximada de 23 nucleòtids, de cadena senzilla i no codificantes que actuen en la regulació post-transcripcional inhibint l'expressió gènica unint-se a llocs específics de ARNm diana. En aquest document s'ha avaluat la viabilitat de diferents models basats en machine learning existents per a la predicció de les dianes de miARN. Es va avaluar la viabilitat de sis models diferents: k-nearest neighbors, Naive Bayes, artificial neural network, support vector machine, decision tree i random forest. Per a l'entrenament dels models es va construir una base de dades amb més de 14.000 interaccions de miARN-ARNm amb 19 features de les mateixes, de les quals, es van seleccionar 3.173 interaccions reals i 3.173 interaccions no reals. El model random forest presento la major eficiència en la predicció d'interaccions, alhora que va ser un dels models més sòlids i més senzills d'entrenar. Per les característiques dels models basats en random forest i a causa de la utilització d'un gran nombre de features per a la predicció de dianes de miARN es recomana l'ús d'aquests models per a futurs estudis de detecció i predicció de dianes de miARNs. |
Paraules clau: | microARN aprenentatge automàtic models de predicció |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | gen-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
Estudio comparativo de modelos de machine learning para la detección de dianas microARN.rar | 4,74 MB | Unknown | Veure/Obrir | |
jmartinezrodriguez9TFM0118memoria.pdf | Memoria del TFM | 1,81 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons