Identification of highly altered genes in breast cancer patients through the integration of multiple omics data

Abstract

In this work we aimed to identify genes in breast cancer patients that were showing alterations at more than one of the considered levels. These levels were Copy Number Variations, Mutations, Differential Transcription and Differential Methylation. This allowed us to see that some genes known to be involved in cancer progression were showing an important accumulation of alterations, while other genes were showing alterations only at one of the considered levels.

En este trabajo, intentamos identificar genes en pacientes con cáncer de mama que mostraban alteraciones en más de uno de los niveles considerados. Estos niveles fueron variaciones de número de copia, mutaciones, transcripción diferencial y metilación diferencial. Esto nos permitió ver que algunos genes que se sabía que estaban involucrados en la progresión del cáncer mostraban una importante acumulación de alteraciones, mientras que otros genes mostraban alteraciones solo en uno de los niveles considerados.

En aquest treball, intentem identificar gens en pacients amb càncer de mama que mostraven alteracions en més d'un dels nivells considerats. Aquests nivells van ser variacions de nombre de còpia, mutacions, transcripció diferencial i metilación diferencial. Això ens va permetre veure que alguns gens que se sabia que estaven involucrats en la progressió del càncer mostraven una important acumulació d'alteracions, mentre que altres gens mostraven alteracions solament en un dels nivells considerats.