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http://hdl.handle.net/10609/82132
Título : | Elucidating the regulation of the Yeast Metabolic Cycle through the integration of gene expression and chromatin status |
Autoría: | Sánchez Gaya, Víctor |
Tutor: | Tarazona Campos, Sonia |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Morán Moreno, Jose Antonio ![]() |
Resumen : | El Ciclo Metabólico de la Levadura (YMC) se ha convertido en un modelo de estudio para analizar la influencia de los cambios metabólicos sobre el estado de la cromatina para la regulación de la expresión génica. Estudios previos han demostrado que el YMC se divide en tres fases principales y han descrito el efecto de ciertas modificaciones de histonas en la regulación génica. Este proyecto constituye una aplicación innovadora de diferentes metodologías estadísticas para la integración de datos de estado de la cromatina (ChIP-Seq) y de expresión génica (RNA-Seq). El uso de modelos de regresión (metodologías N-PLS y MORE) para la integración de ómicas nos ha permitido evaluar la relevancia de las modificaciones de histonas y los factores de transcripción en la regulación de los cambios de expresión génica en el YMC. H3K18ac y H3K9ac resultaron ser las más importantes de las modificaciones estudiadas, mientras que YLR403W, YPL254W, YOR363C, YGL209W y YDR451C fueron los factores de transcripción más relevantes. Se encontró una asociación significativa de co-regulación de la expresión génica entre H3K18ac y los factores de transcripción YPL254W (implicado en la formación del complejo SAGA) y YLR403W (involucrado en el proceso de intercambio de histonas), que evidenciaba el papel crucial de los niveles de acetilació a la hora de regular la expresión génica al YMC mediante la acción coordinada de los factores de transcripción y los niveles de las modificaciones de histonas. De este modo, en este estudio se establecen nuevas conexiones entre el metaboloma, el estado de la cromatina y la expresión génica, así como la base para identificar los posibles reguladores de los mecanismos de regulación que conectan las modificaciones de histonas con los cambios de expresión génica. |
Palabras clave : | RNA-seq datos ómicos ChIP-seq |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 5-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ ![]() |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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