Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/82132
Títol: | Elucidating the regulation of the Yeast Metabolic Cycle through the integration of gene expression and chromatin status |
Autoria: | Sánchez Gaya, Víctor |
Tutor: | Tarazona Campos, Sonia |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Morán Moreno, Jose Antonio |
Resum: | El Cicle Metabòlic del Llevat (YMC) s'ha convertit en un model d'estudi per analitzar la influència dels canvis metabòlics sobre l'estat de la cromatina per a la regulació de l'expressió gènica. Estudis previs han demostrat que el YMC es divideix en tres fases principals i han descrit l'efecte de certes modificacions d'histones en la regulació gènica. Aquest projecte constitueix una aplicació innovadora de diferents metodologies estadístiques per a la integració de dades d'estat de la cromatina (ChIP-Seq) i d'expressió gènica (RNA-Seq). L'ús de models de regressió (metodologies N-PLS i MORE) per a la integració d'òmiques ens ha permés avaluar la rellevància de les modificacions d'histones i els factors de transcripció en la regulació dels canvis d'expressió gènica en el YMC. H3K18ac i H3K9ac van resultar ser les més importants de les modificacions estudiades, mentre que YLR403W, YPL254W, YOR363C, YGL209W i YDR451C van ser els factors de transcripció més rellevants. Es va trobar una associació significativa de co-regulació de l'expressió gènica entre H3K18ac i els factors de transcripció YPL254W (implicat en la formació del complex SAGA) i YLR403W (involucrat en el procés d'intercanvi d'histones), que evidenciava el paper crucial dels nivells d'acetilació a l'hora de regular l'expressió gènica al YMC mitjançant l'acció coordinada dels factors de transcripció i els nivells de les modificacions d'histones. D'aquesta manera, en aquest estudi s'estableixen noves connexions entre el metaboloma, l'estat de la cromatina i l'expressió gènica, així com la base per identificar els possibles reguladors dels mecanismes de regulació que connecten les modificacions d'histones amb els canvis d'expressió gènica. |
Paraules clau: | dades òmiques RNA-seq ChIP-seq |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 5-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
vicsangaTFM0618memory.pdf | Memoria del TFM | 2,48 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons