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http://hdl.handle.net/10609/82605
Título : | Enrich_Gen: Plataforma web para el enriquecimiento clínico y farmacológico de variantes de genes |
Autoría: | Oruezábal Moreno, Mauro Javier |
Tutor: | Rebrij, Romina |
Otros: | Merino, David |
Resumen : | La plataforma Enrich Gen permite, mediante la integración de la información procedente de diversas bases de datos y la visualización en tablas o gráficos, priorizar los genes más relevantes de un análisis; conocer la similitud o distancia entre los genes; disponer del listado de fármacos con actividad para cada gen; conocer los ensayos clínicos desarrollados por gen, y por último, evaluar la evidencia científica de cada gen. Los tres procedimientos fundamentales de la plataforma son: los metadatos, el análisis semántico latente basado en la descomposición de una matriz en sus valores singulares; y el análisis semántico basado en la ontología. El primero, los metadados, se caracterizan por ser datos altamente estructurados debido a las reglas incluidas para su extracción, clasificación y adaptación a la estructura de visualización que permite ganar en eficiencia y/o mejorar la interpretación; el análisis semántico latente basado en la descomposición en valores singulares es usado para la construcción de un gráfico nodo-arco a partir de una busqueda en la plataforma PubMed; y el análisis semántico basado en la ontología, se utiliza para evaluar la similitud de genes basados en los términos GO. Enrich Gen es una herramienta web que permite al usuario extraer información clínica, farmacológica, biológica, y facilita la anotación de un conjunto de genes tras conocer su similitud basada en los términos GO, por lo tanto, es de gran utilidad en la práctica clínica. |
Palabras clave : | descomposición de valores singulares minería de datos análisis semántico latente aplicaciones web |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 16-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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mourezabalTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 2,51 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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