Impacto de la mutación del gen supresor tumoral PTEN en el tratamiento en cáncer

Abstract

El cáncer es la segunda causa de muerte en el mundo. La aparición de mutaciones en ciertos genes es clave para el desarrollo tumoral, siendo una de las mutaciones más frecuentes la alteración del gen supresor tumoral PTEN. Objetivo, identificar una vía metabólica/señalización implicada en la alteración de PTEN y que sea común en diversos cánceres, y los genes que la componen, susceptibles de ser una nueva diana terapéutica. Metodología, se han utilizado bases de datos de microarrays (GEO data). Se obtienen 5 tipos de cánceres con PTEN knock-out (cáncer de colon, mama, epidermoide y pulmón no microcítico en Homo sapiens y cáncer de próstata en Mus musculus). Se analiza la diferente expresión entre la muestra PTEN knock-out y control y se extraen las vías de señalización estadísticamente significativas. Se analizan los genes que las componen. Resultados. La vía de señalización del cáncer de pulmón de células pequeñas (KEGGID: 05222), la vía de señalización de p53 (KEGGID: 04115) y las vías de señalización implicadas en el cáncer (KEGGID: 05200) son las vías de señalización comunes en el cáncer de colon, epidermoide y mama y estadísticamente significativas al comparar el cáncer con deleción del supresor tumoral PTEN con su control. Los genes implicados en estas vías y en común en los diferentes cánceres son TRAF4, TP53 y CDKN1A. Conclusiones, TRAF4, TP53 y CDKN1A son susceptibles de ser nuevas dianas terapéuticas en aquellos cánceres con deleción del gen PTEN.

El càncer és la segona causa de mort en el món. L'aparició de mutacions en certs gens és clau per al desenvolupament tumoral, sent una de les mutacions més freqüents l'alteració del gen supresor tumoral PTEN. Objectiu, identificar una via metabòlica/senyalització implicada en l'alteració de PTEN i que sigui comuna en diversos càncers, i els gens que la componen, susceptibles de ser una nova diana terapèutica. Metodologia, s'han utilitzat bases de dades de bioxips (GEO data). S'obtenen 5 tipus de càncers amb PTEN knock-out (càncer de còlon, mama, epidermoide i pulmó no microcítico en Homo sapiens i càncer de pròstata en Mus musculus). S'analitza la diferent expressió entre la mostra PTEN knock-out i control i s'extreuen les vies de senyalització estadísticament significatives. S'analitzen els gens que les componen. Resultats. La via de senyalització del càncer de pulmó de cèl·lules petites (KEGGID: 05222), la via de senyalització de p53 (KEGGID: 04115) i les vies de senyalització implicades en el càncer (KEGGID: 05200) són les vies de senyalització comunes en el càncer de còlon, epidermoide i mama i estadísticament significatives en comparar el càncer amb deleción del supresor tumoral PTEN amb el seu control. Els gens implicats en aquestes vies i en comú en els diferents càncers són TRAF4, TP53 i CDKN1A. Conclusions, TRAF4, TP53 i CDKN1A són susceptibles de ser noves dianes terapèutiques en aquells càncers amb deleción del gen PTEN.

Cancer is the second leading cause of death globally. It develops mutations in order to proliferate and one of the most frequent one is the PTEN mutation. Objective, to identify a metabolic/signalling pathway common in various cancers that plays a role in the alteration of PTEN. To identify genes included in these pathways susceptible to be new therapeutic targets. Methodology, microarray databases (GEO data) have been used. Five types of cancers were obtained with PTEN deletion (colon, breast, epidermoid and non-small cell lung cancer in Homo sapiens and prostate cancer in Mus muculus). Different expression between PTEN knock-out and control cancer samples was analysed, and statistically significant signalling pathways were extracted. Genes included in these pathways were analysed. Results. The small cell lung cancer (KEGGID: 05222), the p53 signalling (KEGGID: 04115) and pathways involved in cancer (KEGGID: 05200) were statistically significant pathways in colon, epidermoid and breast cancer, when comparing PTEN knock-out and control. Common genes in these pathways were TRAF4, TP53 and CDKN1A. Conclusions. TRAF4, TP53 and CDKN1A are susceptible to be therapeutic targets in those cancers with PTEN deletion.