Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/133108
Títol: | Evaluación de métodos de ensamblado de novo del genoma de Ulmus minor |
Autoria: | Pallarés Zazo, Jorge |
Tutor: | Orengo, Dorcas |
Altres: | Calvet Liñán, Laura |
Resum: | L'om comú (Ulmus minor) és una espècie emblemàtica del territori espanyol, en situació compromesa des del segle XX per la malaltia de la grafiosis. Per a facilitar els esforços de restauració i conservació d'aquesta espècie, aquest treball escomet la creació d'una versió preliminar del genoma d'O. minor mitjançant l'assemblatge de novo de les lectures llargues de seqüenciació (PacBio). Es va utilitzar el programa d'assemblatge Canu i es va obtenir un assemblatge amb 67.706 contigs, una grandària total de 1,09 Gb i un valor de l'estadístic N50 de 57 Kb. En paral·lel, es va procedir a un altre assemblatge mitjançant el programa Falcon, si bé no es va poder obtenir un assemblatge complet, possiblement perquè la cobertura inicial de les lectures (29x) va ser insuficient. No obstant això, aquesta versió preliminar es considera vital per a la comprensió del procés a escala general, detectar deficiències i per tant articular una estratègia sòlida d'assemblatge a futur amb la finalitat de generar un primer genoma de referència de qualitat acceptable per a l'espècie O. minor. |
Paraules clau: | Ulmus minor genoma assemblatge de novo |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 8-jun-2021 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
jpallareszTFM0621memoria.pdf | Memoria del TFM | 1,22 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons