Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/146180
Títol: | Web application for the study of the relationship between obesity and intestinal microbiome based on PubMed text mining |
Autoria: | Torrent Ample, Neus |
Tutor: | Rebrij, Romina |
Altres: | Perez-Navarro, Antoni |
Resum: | A tot el món, la prevalença de l'obesitat ha aconseguit proporcions epidèmiques. L'epidèmia mundial d'obesitat continua el seu implacable avanç, afectant actualment més de 2.000 milions de persones. En l'última dècada, 227 variants genètiques implicades en diferents vies biològiques i la distorsió de l'equilibri microbià normal s'han associat amb l'obesitat i altres malalties metabòliques. Es van aplicar tècniques de mineria de textos a partir de la literatura biomèdica, concretament dels resums de PubMed, per a desenvolupar una aplicació web interactiva, METAVOLIKOS, per a estudiar la relació dels gens i el microbioma intestinal en pacients amb obesitat i altres malalties metabòliques. Concretament, es va estudiar la relació entre els termes mitjançant l'anàlisi semàntica latent i la posterior similitud del cosinus. El pipeline de treball s'integrarà en el desenvolupament de l'aplicació web utilitzant el paquet Shiny de R. S'ha inferit una relació a partir de publicacions sobre malalties metabòliques en les quals no necessàriament s'inclouen articles que incloguin el terme Obesitat o explícitament el gen o el bacteri relacionats. Així, aquest treball mostra com l'anàlisi semàntica latent pot llançar llum per a crear noves hipòtesis de recerca. Els dos principals gens ja relacionats amb diferents malalties metabòliques van ser TG i HR. A més, els gens RBP4 i TF es van presentar com potencialment relacionats amb l'obesitat i són bons candidats per a estudiar la seva relació en pacients amb obesitat. La població de bacteris més relacionada amb l'obesitat i altres malalties metabòliques relacionades són els lactobacilos, els bacterioides i els firmicutes. METAVOLIKOS és una aplicació de mineria de textos fàcilment adaptable i utilitzable pels científics de laboratori, que inspira el desenvolupament de noves línies de recerca. |
Paraules clau: | mineria de dades PubMed metabòlic |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 2-jun-2022 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
ntorrentaFMDP0622report.pdf | Report of TFM | 4,12 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons