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http://hdl.handle.net/10609/81485
Título : | Identificación de vías moleculares alteradas por mutaciones en kras y/o supervivencia en cáncer de colon |
Autoría: | Rodríguez Outeiriño, Lara |
Tutor: | luna, Jeroni |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resumen : | En este trabajo se muestra el estudio comparativo de expresión diferencial de microRNAs (miRs) y ARN mensajeros (ARNm) en pacientes con adenocarcinoma de colon (COAD) subdividiendo a la muestra por dos criterios: estado mutacional de KRAS y baja o alta supervivencia. También se muestran las interacciones entre miRs sobreexpresados y ARNm infraexpresados en pacientes con COAD indicando genes que puedan ejercer alguna función por alteraciones en KRAS o en supervivencia. Los resultados servirán para encontrar posibles predictores moleculares que ayuden a determinar la relación del tumor con mutaciones en KRAS y la tasa de supervivencia. Obtenemos la información de los conteos de genes del repositorio The Genome Cancer Atlas (TCGA), así como los datos clínicos. Trabajamos con el lenguaje de programación R en RStudio, sirviéndonos del repositorio Bioconductor para los análisis bioestadísticos. Para el análisis comparativo de expresión diferencial, búsqueda de interacciones miRs-ARNm y análisis de enriquecimiento GO trabajamos con el paquete miRComb. |
Palabras clave : | cáncer de colon adenocarcinoma microRNA K-ras supervivencia |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 5-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Ficheros en este ítem:
Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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DifExpr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 3,2 MB | Text | Visualizar/Abrir |
DifExpr-ARNm-Superv.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 1,59 MB | Text | Visualizar/Abrir |
DifExpr-miRs-KRAS.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 81,48 kB | Text | Visualizar/Abrir |
DifExpr-miRs-Superv.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 34,98 kB | Text | Visualizar/Abrir |
Expr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 196,82 MB | Text | Visualizar/Abrir |
Expr-ARNm-Superv.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis de supervivencia | 47,61 MB | Text | Visualizar/Abrir |
Expr-miRs-KRAS.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 6,11 MB | Text | Visualizar/Abrir |
Expr-miRs-Superv.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis de supervivencia | 1,71 MB | Text | Visualizar/Abrir |
GO-mutKRAS.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 129,49 kB | Text | Visualizar/Abrir |
GO-superviencia.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 25,62 kB | Text | Visualizar/Abrir |
Top10-miRs-frecARNm-Superv.txt | Resultados top10 interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 166 B | Text | Visualizar/Abrir |
Top10-miRs-namesARNm-Superv.txt | Resultados identificadores interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 54,19 kB | Text | Visualizar/Abrir |
laraouteTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 3,9 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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