Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/81485
Títol: | Identificación de vías moleculares alteradas por mutaciones en kras y/o supervivencia en cáncer de colon |
Autoria: | Rodríguez Outeiriño, Lara |
Tutor: | luna, Jeroni |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resum: | En aquest treball es mostra l'estudi comparatiu d'expressió diferencial de microRNAs (mirs) i ARN missatgers (ARNm) en pacients amb adenocarcinoma de còlon (Coad) subdividint a la mostra per dos criteris: estat mutacional de KRAS i baixa o alta supervivència . També es mostren les interaccions entre mirs sobreexpressats i ARNm infraexpresados en pacients amb Coad indicant gens que puguin exercir alguna funció per alteracions en KRAS o en supervivència. Els resultats serviran per trobar possibles predictors moleculars que ajudin a determinar la relació del tumor amb mutacions en KRAS i la taxa de supervivència. Obtenim la informació dels recomptes de gens del repositori The Genome Cancer Atlas (TCGA), així com les dades clíniques. Treballem amb el llenguatge de programació R en RStudio, servint-nos del repositori Bioconductor per a les anàlisis estadístics. Per a l'anàlisi comparativa d'expressió diferencial, recerca d'interaccions mirs-ARNm i anàlisi d'enriquiment GO treballem amb el paquet miRComb. |
Paraules clau: | càncer de còlon adenocarcinoma microRNA K-ras supervivència |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 5-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
DifExpr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 3,2 MB | Text | Veure/Obrir |
DifExpr-ARNm-Superv.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 1,59 MB | Text | Veure/Obrir |
DifExpr-miRs-KRAS.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 81,48 kB | Text | Veure/Obrir |
DifExpr-miRs-Superv.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 34,98 kB | Text | Veure/Obrir |
Expr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 196,82 MB | Text | Veure/Obrir |
Expr-ARNm-Superv.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis de supervivencia | 47,61 MB | Text | Veure/Obrir |
Expr-miRs-KRAS.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 6,11 MB | Text | Veure/Obrir |
Expr-miRs-Superv.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis de supervivencia | 1,71 MB | Text | Veure/Obrir |
GO-mutKRAS.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 129,49 kB | Text | Veure/Obrir |
GO-superviencia.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 25,62 kB | Text | Veure/Obrir |
Top10-miRs-frecARNm-Superv.txt | Resultados top10 interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 166 B | Text | Veure/Obrir |
Top10-miRs-namesARNm-Superv.txt | Resultados identificadores interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 54,19 kB | Text | Veure/Obrir |
laraouteTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 3,9 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons