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http://hdl.handle.net/10609/81485
Title: | Identificación de vías moleculares alteradas por mutaciones en kras y/o supervivencia en cáncer de colon |
Author: | Rodríguez Outeiriño, Lara |
Tutor: | luna, Jeroni |
Others: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Abstract: | In this study we show a comparative study of miRs's and mRNA's differentially expressed genes in patients with colon adenocarcinome (COAD), subdividing the sample by two criteria: KRAS mutational status and survival¿s rate. The interactions between overexpressed miRs and underexpressed mRNA in the disease are also shown. This can indicate genes that may play a role in COAD. Results can be used to find possible molecular predictors that would help us determine the relationship of tumours with KRAS mutation and/or survival rate. Using The Genome Cancer Atlas (TCGA) genomic information, miRs and mRNA counts were extracted, as well as clinical data. For computing bio statistical analysis, we use Bioconductor repository which use R statistical programming language in RStudio. Differential expression comparative searching for miRs-mRNA interaction and GO enrichment analysis was computed with the package miRComb. |
Keywords: | colon cancer adenocarcinoma microARN K-ras survival |
Document type: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Issue Date: | 5-Jun-2018 |
Publication license: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Appears in Collections: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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File | Description | Size | Format | |
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DifExpr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 3,2 MB | Text | View/Open |
DifExpr-ARNm-Superv.txt | Resultados de ARNm diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 1,59 MB | Text | View/Open |
DifExpr-miRs-KRAS.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 81,48 kB | Text | View/Open |
DifExpr-miRs-Superv.txt | Resultados de miRs diferencialmente expresados en COAD según la supervivencia | 34,98 kB | Text | View/Open |
Expr-ARNm-KRAS.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 196,82 MB | Text | View/Open |
Expr-ARNm-Superv.txt | Resultados de expresión de ARNm en COAD para el análisis de supervivencia | 47,61 MB | Text | View/Open |
Expr-miRs-KRAS.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis según el estado mutacional de KRAS | 6,11 MB | Text | View/Open |
Expr-miRs-Superv.txt | Resultados de expresión de miRs en COAD para el análisis de supervivencia | 1,71 MB | Text | View/Open |
GO-mutKRAS.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según el estado mutacional de KRAS | 129,49 kB | Text | View/Open |
GO-superviencia.txt | Resultados de GO de genes diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 25,62 kB | Text | View/Open |
Top10-miRs-frecARNm-Superv.txt | Resultados top10 interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 166 B | Text | View/Open |
Top10-miRs-namesARNm-Superv.txt | Resultados identificadores interacciones miRs-ARNm diferencialmente expresados en COAD según supervivencia | 54,19 kB | Text | View/Open |
laraouteTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 3,9 MB | Adobe PDF | View/Open |
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