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http://hdl.handle.net/10609/81766
Título : | El paquete methylearning y su aplicación Shiny: selección de marcadores y clasificación a partir de datos de metilación del DNA |
Autoría: | Piñeyro Valerio, David |
Tutor: | Adsuar Gómez, Antonio Jesús |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Marco-Galindo, Maria-Jesús |
Resumen : | La aplicación de técnicas de Machine Learning, en el contexto del diagnóstico y la prevención, es un campo de gran interés en la actualidad. De entre los datos biológicos que se pueden emplear en este escenario, los datos masivos generados por las técnicas de alto rendimiento actuales representan una gran oportunidad para el avance de la medicina. Entre ellos, los datos epigenéticos han demostrado su utilidad para el diagnóstico de muchas enfermedades de gran impacto social, tales como el cáncer o las enfermedades neurodegenerativas. Sin embargo, la construcción de un modelo de clasificación basado en este tipo de datos es un proceso laborioso, que requiere de un fino equilibrio entre las técnicas de selección de variables, imprescindibles para datos de alta dimensionalidad, y las técnicas de clasificación. Con el fin de proporcionar un marco de trabajo completo, robusto y sencillo para el proceso de creación de modelos de clasificación basados en datos epigenéticos, se ha creado el paquete methylearning. Programado en R, está pensado para asistir en las tareas de selección de marcadores y clasificación, facilitando la exploración de multitud de combinaciones y generando una gran riqueza de datos, tanto númericos como gráficos, con los que contrastar el rendimiento de diferentes algoritmos. Además, para facilitar el acceso a la herramienta a un público más amplio, también se ha diseñado una aplicación web, basada en Shiny, que proporciona toda la funcionalidad del paquete methylearning, sin necesidad de tener conocimientos de programación. |
Palabras clave : | selección de marcadores metilación clasificación |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 6-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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