Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/81889
Títol: | Ensamblaje de novo y anotación génica del genoma de Leishmania major mediante secuenciación masiva |
Autoria: | González de la Fuente, Sandra |
Tutor: | Ylla Bou, Guillem |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resum: | La leishmaniasis és una malaltia parasitaria produïda per protozous del gènere Leishmania. Leishmania major és l'espècie prototípica associada amb la leishmaniasis cutània al Vell Món sent la forma més freqüent de leishmaniasis. L'obtenció d'una seqüencia genòmica fiable és fonamental per a estudis moleculars conduents al desenvolupament d'estratègies de control de la leishmaniasis. A pesar que el genoma de referència de L. major està assemblat en les bases de dades en 36 cromosomes, dades publicades recentment van evidenciar l'existència d'errors, a causa de col·lapses provocats per l'existència de regions repetitives. L'objectiu d'aquest treball va ser generar un assemblatge millorat del genoma de L. major, seqüenciant el genoma mitjançant lectures de PacBio i Illumina i emprant diverses estratègies d'assemblatge: assemblatges no-híbrids i híbrids (combinant ambdues lectures). Els assemblatges no-híbrids amb lectures de PacBio van generar els millors resultats. No obstant això, les lectures de Illumina han estat essencials per estendre extrems de cromosomes i corregir regions homopolimèriques, on s'ha trobat que PacBio té limitacions. |
Paraules clau: | Leishmania NGS assemblatge de novo |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 4-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
sgonzalezdelaTFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 4,15 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons