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http://hdl.handle.net/10609/81973
Título : | Desarrollo y optimización de un pipeline para el análisis dual del transcriptoma planta/patógeno: identificando los mecanismos de patogenicidad y defensa |
Autoría: | Martín García, Jorge |
Tutor: | Ylla Bou, Guillem |
Otros: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resumen : | El presente Trabajo Fin de Máster se centra en el análisis dual del transcriptoma del patosistema Eucalyptus grandis/ Chrysoporthe austroafricana, testando la resistencia genética del hospedante y el efecto de la infección del patógeno. Se ha desarrollado un pipeline y su correspondiente script para la descarga y procesado de secuencias, y el posterior análisis de RNA-seq. Los requerimientos de computación para llevar a cabo este tipo de análisis de RNA-seq y la importancia del número de réplicas biológicas son discutidos. Los niveles de expresión génica en el hospedante se ven influenciados tanto por la genética de la planta como por la infección de la planta. El análisis de enriquecimiento funcional ha supuesto la mejora del conocimiento de los procesos biológicos implicados en los mecanismos de respuesta de la planta frente a la infección del patógeno en este patosistema. |
Palabras clave : | expresión génica RNA-seq patogenicidad |
Tipo de documento: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Fecha de publicación : | 5-jun-2018 |
Licencia de publicación: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/es/ |
Aparece en las colecciones: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
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Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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jmartingarcia5TFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 3,04 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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