Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/81973
Títol: | Desarrollo y optimización de un pipeline para el análisis dual del transcriptoma planta/patógeno: identificando los mecanismos de patogenicidad y defensa |
Autoria: | Martín García, Jorge |
Tutor: | Ylla Bou, Guillem |
Altres: | Universitat Oberta de Catalunya Merino, David |
Resum: | El present Treball de Final de Màster es centra en l'anàlisi dual del transcriptoma del patosistema Eucalyptus grandis / Chrysoporthe austroafricana, testejant la resistència genètica del hoste i l'efecte de la infecció del patogen. S'ha desenvolupat una pipeline i el seu corresponent script per la baixada i processat de seqüència, i el posterior anàlisi de RNA-seq. Els requisits de computació per dur a terme aquest tipus d'anàlisi de RNA-seq i la importància de les rèpliques biològiques es discuteixen. Els nivells d'expressió gènica en l'hoste es veuen influenciats tan per la genètica de la planta com per la infecció. L'anàlisi d'enriquiment funcional ha suposat una millora del coneixement dels processos biològics implicats en els mecanismes de resposta de la planta envers a la infecció pel patogen en aquest patosistema. |
Paraules clau: | expressió gènica RNA-seq patogenicitat |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | 5-jun-2018 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
jmartingarcia5TFM0618memoria.pdf | Memoria del TFM | 3,04 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
jmartingarcia5TFM0618presentación.pdf | Presentación del TFM | 2,77 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons