Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/120806
Títol: | Análisis de pathways y redes de interacción génica en enfermedades complejas |
Autoria: | Álamo Álvarez, María Inmaculada |
Tutor: | Sastre Tomas, Jaume Peña-Chilet, Maria Dopazo, Joaquin |
Altres: | Ventura, Carles |
Resum: | En aquest treball s'ha creat un flux de treball i un seguit d'scripts que serveixen per assistir a la generació de mapes de malaltia (mapa d'enriquiment funcional i mapa d'interaccions entre proteïnes associades) partint de dades d'estadístiques globals que provenen d'estudis de associació de genoma complet (GWAS). Es va seleccionar l'asma com a exemple de malaltia complexa per a realitzar una prova de concepte. S'han obtingut dades d'associacions de variants de la base de dades GWAS Catalog, s'ha realitzat una anàlisi d'enriquiment funcional amb g: Profiler i s'han visualitzat les xarxes obtingudes en Cytoscape utilitzant els connectors de l'pipeline de EnrichmentMap i stringApp. El codi utilitzat (R i bash) està disponible a https://github.com/mialaalv/pathWAS. |
Paraules clau: | rutes mecanístiques malalties complexes estudis d'associació de genoma complet |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | jun-2020 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
mialaalvTFM0620memoria.pdf | Memoria del TFM | 1,77 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative Commons Llicència Creative Commons