Empreu aquest identificador per citar o enllaçar aquest ítem:
http://hdl.handle.net/10609/147684
Títol: | Network analysis of transcriptional regulation of acinar cell identity using transcription factor footprinting inference from ATAC-seq data |
Autoria: | Soriano-Díaz, Francisco Javier |
Tutor: | Martínez de Villarreal, Jaime BASSAGANYAS, LAIA |
Resum: | La identitat cel·lular pot considerar-se un important mecanisme supresor de tumors. En aquest context, l'esclariment dels mecanismes reguladors d'aquesta identitat, fonamentalment de l'activitat dels factors de transcripció que regulen l'expressió de diferents programes transcripcionales, resulta essencial. Prenent com a punt de partida l'estructura tridimensional de la cromatina a partir de les dades proporcionades per la tècnica Assay for TransposaseAccessible Chromatin using sequencing (ATAC-seq), es pretenen esclarir les xarxes transcripcionales implicades en el manteniment de les condicions homeostàtiques en pàncrees murino per a posteriorment reconèixer aquells programes transcripcionales implicats en la pèrdua d'identitat cel·lular necessària en el procés carcinogénico. Per a això, es disposa de dades provinents d'animals modificats genèticament usats com a models en l'estudi de l'adenocarcinoma pancreàtic ductal (pancreaticductal adenocarcinoma, PDAC). Amb aquest treball s'espera tenir una millor comprensió de les xarxes de regulació gènica i per tant de la relació existent entre els factors de transcripció, els seus llocs d'unió i els gens involucrats en el càncer estudiat. Amb la creació d'aquestes xarxes es podran confirmar resultats obtinguts experimentalment, així com servir de base per a noves recerques, establint-se una relació bidireccional entre el treball computacional i el realitzat en el laboratori. Així mateix, s'espera poder presentar la informació aquí obtinguda com un recurs que pugui ser emprat per altres investigadors per als seus treballs. Tot això té l'objectiu final de conèixer millor i combatre el càncer de pàncrees. |
Paraules clau: | bioinformàtica regulació transcripcional identitat acinar |
Tipus de document: | info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Data de publicació: | jun-2022 |
Llicència de publicació: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/es/ |
Apareix a les col·leccions: | Trabajos finales de carrera, trabajos de investigación, etc. |
Arxius per aquest ítem:
Arxiu | Descripció | Mida | Format | |
---|---|---|---|---|
fjsorianodFMDP0622report.pdf | FMDP Report | 3,9 MB | Adobe PDF | Veure/Obrir |
Comparteix:
Aquest ítem està subjecte a una llicència de Creative CommonsLlicència Creative Commons